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dom
4e2b4bd946 refactor: réorganisation référentiels, nouveaux modules extraction, nettoyage code obsolète
- Réorganisation data/referentiels/ : pdfs/, dicts/, user/ (structure unifiée)
- Fix badges "Source absente" sur page admin référentiels
- Ré-indexation COCOA 2025 (555 → 1451 chunks, couverture 94%)
- Fix VRAM OOM : embeddings forcés CPU via T2A_EMBED_CPU
- Nouveaux modules : document_router, docx_extractor, image_extractor, ocr_engine
- Module complétude (quality/completude.py + config YAML)
- Template DIM (synthèse dimensionnelle)
- Gunicorn config + systemd service t2a-viewer
- Suppression t2a_install_rag_cleanup/ (copie obsolète)
- Suppression scripts/ et scripts_t2a_v2/ (anciens benchmarks)
- Suppression 81 fichiers _doc.txt de test
- Cache Ollama : TTL configurable, corrections loader YAML
- Dashboard : améliorations templates (base, index, detail, cpam, validation)

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-03-07 16:48:10 +01:00
dom
ce7a9650af feat: méthode TIM experte CPAM + moteur de règles étendu
CPAM — Méthode TIM (mémoire en défense) :
- Réécriture CPAM_ARGUMENTATION avec raisonnement 5 passes TIM
  (contexte admin → motif réel → confrontation bio → hiérarchie → validation défensive)
- _BIO_THRESHOLDS (19 entrées) + _build_bio_confrontation() pour
  confrontation biologie/diagnostic avec seuils chiffrés et verdicts
- _format_response() dual format : nouveau TIM (moyens numérotés, tableau
  bio, codes non défendables, conclusion dispositive) + rétrocompat legacy
- CPAM_ADVERSARIAL mis à jour pour vérifier honnêteté intellectuelle
- Tests adaptés + 12 nouveaux tests (bio confrontation, format TIM)

Moteur de règles :
- Nouvelles règles YAML : demographic, diagnostic_conflicts,
  procedure_diagnosis, temporal, parcours
- Bio extraction FAISS (synonymes vectoriels)
- Veto engine enrichi (citations, Trackare skip, règles démographiques)
- Decision engine : _apply_bio_rules_gen() + matchers analytiques

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-03-04 11:57:07 +01:00
dom
909e051cc9 feat: architecture multi-modèles LLM + quality engine + benchmark
- Multi-modèles : 4 rôles LLM (coding=gemma3:27b-cloud, cpam=gemma3:27b-cloud,
  validation=deepseek-v3.2:cloud, qc=gemma3:12b) avec get_model(role)
- Prompts externalisés : 7 templates dans src/prompts/templates.py
- Cache Ollama : modèle stocké par entrée (migration auto ancien format)
- call_ollama() : paramètre role= (priorité: model > role > global)
- Quality engine : veto_engine + decision_engine + rules_router (YAML)
- Benchmark qualité : scripts/benchmark_quality.py (A/B, métriques CIM-10)
- Fix biologie : valeurs qualitatives (troponine négative) non filtrées
- Fix CPAM : gemma3:27b-cloud au lieu de deepseek (JSON tronqué par thinking)
- CPAM max_tokens 4000→6000, viewer admin multi-modèles
- Benchmark 10 dossiers : 100% DAS valides, 10/10 CPAM, 243s/dossier

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-02-20 00:21:09 +01:00
dom
aa397d5360 feat: configuration externalisée via .env + audit requirements
- Externalise 13 variables de config via python-dotenv (chemins PDF,
  modèles Ollama/embedding/NER, FINESS, seuils) avec défauts identiques
- Centralise EMBEDDING_MODEL dans config.py (était hardcodé en 3 endroits)
- Ajoute .env.example documenté et .env au .gitignore
- Ajoute openpyxl et pandas manquants au requirements.txt
- Ajoute data/referentiels au mkdir de run.sh

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-02-13 19:46:33 +01:00
dom
037d255aa0 feat: ajout viewer Flask CIM-10 avec config Ollama centralisée et chronométrage
Ajoute une interface web Flask pour visualiser les dossiers médicaux CIM-10,
avec temps de traitement par PDF, sélecteur de modèle Ollama, et centralisation
de la config Ollama dans src/config.py.

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-02-10 20:11:07 +01:00
dom
4d6fbef2b9 feat: ajout RAG CIM-10 avec FAISS + Ollama
Implémente un système RAG (Retrieval Augmented Generation) qui indexe
les documents de référence ATIH (CIM-10 FR 2026, Guide Métho MCO,
CCAM PMSI) et utilise Ollama (mistral-small3.2:24b) pour justifier
et valider le codage CIM-10 des diagnostics.

- Nouveaux modèles Pydantic : RAGSource, Diagnostic étendu (confidence,
  justification, sources_rag) — rétrocompatible
- Module rag_index.py : chunking des 3 PDFs, embedding sentence-camembert-large,
  index FAISS IndexFlatIP (3630 vecteurs)
- Module rag_search.py : recherche FAISS + appel Ollama avec fallback double
- Flag CLI --no-rag pour désactiver l'enrichissement RAG
- 18 nouveaux tests (88/88 passent)

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-02-10 17:47:08 +01:00
dom
4a12cd2676 feat: pipeline T2A - anonymisation, extraction CIM-10 et intégration edsnlp
Pipeline complet de traitement de documents médicaux PDF :
- Extraction texte (pdfplumber) et classification (Trackare/CRH)
- Anonymisation multi-couche (regex + NER CamemBERT + sweep)
- Extraction médicale CIM-10 hybride : edsnlp (AP-HP) enrichit les
  diagnostics, médicaments (codes ATC via Romedi) et négation,
  avec fallback regex pour les patterns spécifiques
- Fix sentencepiece pinné à <0.2.0 pour compatibilité CamemBERT

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-02-10 15:24:12 +01:00