- vlm_manager: ajout format:json dans payload Ollama (élimine hallucinations JSON) - vlm_manager: retour modèle local qwen2.5vl:7b (sécurité données médicales) - anonymizer_core: ajout import logging (fix NameError silencieux qui tuait le VLM) - anonymizer_core: masquage direct pages manuscrites (suppression rotation inutile) - GUI: intégration checkbox VLM + auto-load EDS-Pseudo prioritaire Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
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14 KiB
Python
401 lines
14 KiB
Python
#!/usr/bin/env python3
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# -*- coding: utf-8 -*-
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"""
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VLM Manager — Analyse visuelle des PDF via Ollama (qwen3-vl)
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-------------------------------------------------------------
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Couche complémentaire aux regex/NER : envoie chaque page PDF comme image
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à un VLM local (Ollama) pour détecter visuellement les PII.
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Dégradation gracieuse : si Ollama est indisponible, le pipeline continue sans VLM.
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Dépendances : aucune (utilise uniquement urllib de la stdlib).
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"""
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from __future__ import annotations
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import base64
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import io
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import json
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import logging
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import urllib.error
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import urllib.request
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from dataclasses import dataclass, field
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from typing import Any, Dict, List, Optional, Tuple
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try:
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from PIL import Image
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except ImportError:
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Image = None # type: ignore
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log = logging.getLogger(__name__)
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# ---------------------------------------------------------------------------
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# Configuration
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# ---------------------------------------------------------------------------
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@dataclass
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class VlmConfig:
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"""Configuration pour le VLM Ollama."""
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base_url: str = "http://localhost:11434"
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model: str = "qwen2.5vl:7b"
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timeout: int = 180
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max_image_size: int = 2048 # pixels (côté le plus long)
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temperature: float = 0.1
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num_predict: int = 8192
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min_confidence: float = 0.5
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# ---------------------------------------------------------------------------
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|
# Mapping catégories VLM → (PiiHit.kind, clé PLACEHOLDERS)
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# ---------------------------------------------------------------------------
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|
VLM_CATEGORY_MAP: Dict[str, Tuple[str, str]] = {
|
|
"NOM": ("VLM_NOM", "NOM"),
|
|
"PRENOM": ("VLM_NOM", "NOM"),
|
|
"ADRESSE": ("VLM_ADRESSE", "ADRESSE"),
|
|
"TELEPHONE": ("VLM_TEL", "TEL"),
|
|
"EMAIL": ("VLM_EMAIL", "EMAIL"),
|
|
"DATE_NAISSANCE": ("VLM_DATE_NAISS", "DATE_NAISSANCE"),
|
|
"NIR": ("VLM_NIR", "NIR"),
|
|
"IPP": ("VLM_IPP", "IPP"),
|
|
"CODE_POSTAL": ("VLM_CP", "CODE_POSTAL"),
|
|
"VILLE": ("VLM_VILLE", "VILLE"),
|
|
"RPPS": ("VLM_RPPS", "RPPS"),
|
|
# Identifiants médicaux / traçabilité
|
|
"NUMERO_PATIENT": ("VLM_NUM_PATIENT", "DOSSIER"),
|
|
"NUMERO_LOT": ("VLM_NUM_LOT", "MASK"),
|
|
"NUMERO_ORDONNANCE":("VLM_NUM_ORD", "DOSSIER"),
|
|
"NUMERO_SEJOUR": ("VLM_NDA", "NDA"),
|
|
"NDA": ("VLM_NDA", "NDA"),
|
|
"SERVICE": ("VLM_SERVICE", "MASK"),
|
|
"ETABLISSEMENT": ("VLM_ETAB", "ETAB"),
|
|
"DATE": ("VLM_DATE", "DATE"),
|
|
"AGE": ("VLM_AGE", "AGE"),
|
|
}
|
|
|
|
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# ---------------------------------------------------------------------------
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|
# Prompt système
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# ---------------------------------------------------------------------------
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|
_SYSTEM_PROMPT = (
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|
"Tu identifies les données personnelles et identifiants traçables dans les documents "
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|
"médicaux français. Réponds uniquement en JSON."
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)
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|
_USER_PROMPT_TEMPLATE = """\
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|
Identifie TOUTES les informations permettant d'identifier un patient dans cette page de document médical.
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|
Le document peut être pivoté ou manuscrit — lis dans toutes les orientations.
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|
Catégories :
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|
- NOM, PRENOM : noms et prénoms de patients, médecins, infirmiers, soignants
|
|
- ADRESSE : adresses postales
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|
- TELEPHONE : numéros de téléphone
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|
- DATE_NAISSANCE : dates de naissance
|
|
- DATE : toutes les autres dates (consultation, séjour, transfusion, intervention…)
|
|
- NIR : numéro de sécurité sociale
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|
- IPP : identifiant permanent du patient (ex: BA172948)
|
|
- NDA : numéro de dossier administratif / numéro de séjour
|
|
- NUMERO_PATIENT : tout numéro identifiant un patient (numéro EFS, numéro d'ordonnance…)
|
|
- NUMERO_LOT : numéros de lots de produits sanguins (PSL), codes numériques de traçabilité
|
|
- CODE_POSTAL, VILLE : codes postaux et villes
|
|
- ETABLISSEMENT : noms d'hôpitaux, cliniques (ex: CH COTE BASQUE, CHU BORDEAUX)
|
|
- SERVICE : noms de services hospitaliers (ex: CANCEROLOGIE HDJ, REANIMATION)
|
|
- AGE : âge du patient (ex: 85A, 62 ans)
|
|
- RPPS : numéro RPPS du médecin
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Règles :
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- Texte EXACT visible sur l'image (copie fidèle, y compris manuscrit)
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|
- Inclure TOUS les identifiants numériques (manuscrits ou imprimés)
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|
- Inclure les noms d'établissements et de services hospitaliers
|
|
- Ne PAS inclure : médicaments, diagnostics, termes médicaux purs, résultats de labo
|
|
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|
Réponds en JSON : {{"entites": [{{"categorie": "NOM", "texte": "DUPONT", "confiance": 0.95}}]}}
|
|
Si aucune PII : {{"entites": []}}"""
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# ---------------------------------------------------------------------------
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|
# VlmManager
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|
# ---------------------------------------------------------------------------
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|
|
class VlmManager:
|
|
"""Gestionnaire VLM via Ollama. Même pattern que NerModelManager."""
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|
|
|
def __init__(self, config: Optional[VlmConfig] = None):
|
|
self._config = config or VlmConfig()
|
|
self._loaded = False
|
|
self._model_name: Optional[str] = None
|
|
|
|
# ---- public API ----
|
|
|
|
def is_loaded(self) -> bool:
|
|
return self._loaded
|
|
|
|
def load(self, model: Optional[str] = None) -> None:
|
|
"""Vérifie la connexion Ollama et la disponibilité du modèle."""
|
|
cfg = self._config
|
|
if model:
|
|
cfg.model = model
|
|
self._model_name = cfg.model
|
|
|
|
# 1) Vérifier qu'Ollama répond
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|
try:
|
|
req = urllib.request.Request(
|
|
f"{cfg.base_url}/api/tags",
|
|
method="GET",
|
|
)
|
|
with urllib.request.urlopen(req, timeout=10) as resp:
|
|
data = json.loads(resp.read().decode("utf-8"))
|
|
except Exception as e:
|
|
raise RuntimeError(f"Ollama indisponible ({cfg.base_url}) : {e}") from e
|
|
|
|
# 2) Vérifier que le modèle est disponible
|
|
available = [m.get("name", "") for m in data.get("models", [])]
|
|
# Normaliser : "qwen3-vl:8b" matche "qwen3-vl:8b" ou "qwen3-vl:8b-..."
|
|
model_found = any(
|
|
a == cfg.model or a.startswith(cfg.model.split(":")[0] + ":")
|
|
for a in available
|
|
)
|
|
if not model_found:
|
|
raise RuntimeError(
|
|
f"Modèle '{cfg.model}' non trouvé dans Ollama. "
|
|
f"Disponibles : {', '.join(available) or '(aucun)'}. "
|
|
f"Lancez : ollama pull {cfg.model}"
|
|
)
|
|
|
|
self._loaded = True
|
|
log.info("VLM prêt : %s via %s", cfg.model, cfg.base_url)
|
|
|
|
def unload(self) -> None:
|
|
self._loaded = False
|
|
self._model_name = None
|
|
|
|
@staticmethod
|
|
def models_catalog() -> Dict[str, str]:
|
|
return {
|
|
"Qwen2.5-VL 7B (Ollama)": "qwen2.5vl:7b",
|
|
"Qwen3-VL 8B (Ollama)": "qwen3-vl:8b",
|
|
}
|
|
|
|
# ---- analyse d'une page ----
|
|
|
|
def analyze_page_image(
|
|
self,
|
|
image: "Image.Image",
|
|
page_number: int = 0,
|
|
existing_pii: Optional[List[str]] = None,
|
|
) -> List[Dict[str, Any]]:
|
|
"""Envoie une image de page à Ollama et retourne les entités détectées.
|
|
|
|
Returns:
|
|
Liste de dicts avec clés : categorie, texte, confiance
|
|
"""
|
|
if not self._loaded:
|
|
return []
|
|
if Image is None:
|
|
log.warning("Pillow non disponible, VLM ignoré")
|
|
return []
|
|
|
|
cfg = self._config
|
|
|
|
# Redimensionner l'image
|
|
img = _resize_image(image, cfg.max_image_size)
|
|
|
|
# Encoder en base64
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|
img_b64 = _image_to_base64(img)
|
|
|
|
# Construire le prompt utilisateur
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|
user_prompt = _USER_PROMPT_TEMPLATE
|
|
if existing_pii:
|
|
user_prompt += (
|
|
"\n\nPII déjà détectés (vérifie et cherche ceux qui manquent) : "
|
|
+ ", ".join(existing_pii[:20])
|
|
)
|
|
|
|
# Appel API Ollama — format: json force une sortie JSON valide
|
|
payload = {
|
|
"model": cfg.model,
|
|
"messages": [
|
|
{"role": "system", "content": _SYSTEM_PROMPT},
|
|
{
|
|
"role": "user",
|
|
"content": user_prompt,
|
|
"images": [img_b64],
|
|
},
|
|
],
|
|
"format": "json",
|
|
"stream": False,
|
|
"options": {
|
|
"temperature": cfg.temperature,
|
|
"num_predict": cfg.num_predict,
|
|
},
|
|
}
|
|
|
|
try:
|
|
body = json.dumps(payload).encode("utf-8")
|
|
req = urllib.request.Request(
|
|
f"{cfg.base_url}/api/chat",
|
|
data=body,
|
|
headers={"Content-Type": "application/json"},
|
|
method="POST",
|
|
)
|
|
with urllib.request.urlopen(req, timeout=cfg.timeout) as resp:
|
|
result = json.loads(resp.read().decode("utf-8"))
|
|
except urllib.error.URLError as e:
|
|
log.warning("VLM appel échoué (page %d) : %s", page_number, e)
|
|
return []
|
|
except Exception as e:
|
|
log.warning("VLM erreur inattendue (page %d) : %s", page_number, e)
|
|
return []
|
|
|
|
# Extraire le contenu de la réponse
|
|
# Qwen3 peut mettre la réponse dans "content" ou "thinking"
|
|
content = ""
|
|
msg = result.get("message", {})
|
|
if isinstance(msg, dict):
|
|
content = msg.get("content", "")
|
|
# Fallback : si content vide, chercher dans thinking (mode Qwen3)
|
|
if not content.strip():
|
|
content = msg.get("thinking", "")
|
|
elif isinstance(msg, str):
|
|
content = msg
|
|
|
|
# Parser le JSON de réponse (défensif)
|
|
entities = _parse_vlm_response(content)
|
|
|
|
log.info("VLM page %d : %d entités détectées", page_number, len(entities))
|
|
return entities
|
|
|
|
|
|
# ---------------------------------------------------------------------------
|
|
# Helpers
|
|
# ---------------------------------------------------------------------------
|
|
|
|
def _resize_image(img: "Image.Image", max_size: int) -> "Image.Image":
|
|
"""Redimensionne l'image si un côté dépasse max_size, en conservant le ratio."""
|
|
w, h = img.size
|
|
if max(w, h) <= max_size:
|
|
return img
|
|
ratio = max_size / max(w, h)
|
|
new_w = int(w * ratio)
|
|
new_h = int(h * ratio)
|
|
return img.resize((new_w, new_h), Image.LANCZOS)
|
|
|
|
|
|
def _image_to_base64(img: "Image.Image") -> str:
|
|
"""Encode une image PIL en base64 (PNG)."""
|
|
buf = io.BytesIO()
|
|
img.save(buf, format="PNG")
|
|
return base64.b64encode(buf.getvalue()).decode("ascii")
|
|
|
|
|
|
def _parse_vlm_response(content: str) -> List[Dict[str, Any]]:
|
|
"""Parse la réponse du VLM en liste d'entités. Gère JSON brut, markdown code blocks,
|
|
et JSON noyé dans du texte de raisonnement (thinking)."""
|
|
if not content or not content.strip():
|
|
return []
|
|
|
|
import re
|
|
text = content.strip()
|
|
|
|
# Tentative 1 : JSON direct
|
|
try:
|
|
data = json.loads(text)
|
|
return _extract_entities(data)
|
|
except json.JSONDecodeError:
|
|
pass
|
|
|
|
# Tentative 2 : extraire un bloc ```json ... ``` ou ``` ... ```
|
|
m = re.search(r"```(?:json)?\s*\n?(.*?)```", text, re.DOTALL)
|
|
if m:
|
|
try:
|
|
data = json.loads(m.group(1).strip())
|
|
return _extract_entities(data)
|
|
except json.JSONDecodeError:
|
|
pass
|
|
|
|
# Tentative 3 : chercher un bloc JSON contenant "entites" ou "entities"
|
|
# Gérer les accolades imbriquées en trouvant le bon bloc
|
|
for keyword in ['"entites"', '"entities"']:
|
|
idx = text.find(keyword)
|
|
if idx < 0:
|
|
continue
|
|
# Remonter jusqu'au { ouvrant
|
|
brace_start = text.rfind("{", 0, idx)
|
|
if brace_start < 0:
|
|
continue
|
|
# Trouver le } fermant correspondant (gestion profondeur)
|
|
depth = 0
|
|
for i in range(brace_start, len(text)):
|
|
if text[i] == "{":
|
|
depth += 1
|
|
elif text[i] == "}":
|
|
depth -= 1
|
|
if depth == 0:
|
|
try:
|
|
data = json.loads(text[brace_start:i + 1])
|
|
return _extract_entities(data)
|
|
except json.JSONDecodeError:
|
|
break
|
|
break
|
|
|
|
# Tentative 4 : chercher le premier { ... } (fallback)
|
|
brace_start = text.find("{")
|
|
brace_end = text.rfind("}")
|
|
if brace_start >= 0 and brace_end > brace_start:
|
|
try:
|
|
data = json.loads(text[brace_start:brace_end + 1])
|
|
return _extract_entities(data)
|
|
except json.JSONDecodeError:
|
|
pass
|
|
|
|
# Tentative 5 : réparation JSON tronqué (num_predict dépassé)
|
|
# Le VLM a pu couper la réponse au milieu d'un objet entité
|
|
brace_start = text.find("{")
|
|
if brace_start >= 0:
|
|
fragment = text[brace_start:]
|
|
# Trouver la dernière entité complète (se terminant par })
|
|
last_complete = fragment.rfind("}")
|
|
if last_complete > 0:
|
|
truncated = fragment[:last_complete + 1]
|
|
# Fermer le tableau et l'objet si nécessaire
|
|
for suffix in ["", "]}", "]}}"]:
|
|
try:
|
|
data = json.loads(truncated + suffix)
|
|
entities = _extract_entities(data)
|
|
if entities:
|
|
log.info("VLM : JSON tronqué réparé (%d entités récupérées)", len(entities))
|
|
return entities
|
|
except json.JSONDecodeError:
|
|
continue
|
|
|
|
log.warning("VLM : impossible de parser la réponse JSON : %s", text[:200])
|
|
return []
|
|
|
|
|
|
def _extract_entities(data: Any) -> List[Dict[str, Any]]:
|
|
"""Extrait la liste d'entités depuis la structure JSON parsée."""
|
|
raw_list = []
|
|
if isinstance(data, dict):
|
|
# Structure attendue : {"entites": [...]}
|
|
raw_list = data.get("entites") or data.get("entities") or []
|
|
if not isinstance(raw_list, list):
|
|
raw_list = []
|
|
elif isinstance(data, list):
|
|
raw_list = data
|
|
|
|
result = []
|
|
for e in raw_list:
|
|
if not isinstance(e, dict):
|
|
continue
|
|
texte = e.get("texte") or e.get("text") or ""
|
|
if not texte:
|
|
continue
|
|
# Accepter les entités sans catégorie (default NOM)
|
|
categorie = e.get("categorie") or e.get("category") or "NOM"
|
|
result.append({
|
|
"categorie": categorie.upper(),
|
|
"texte": texte,
|
|
"confiance": float(e.get("confiance", e.get("confidence", 0.8))),
|
|
})
|
|
return result
|