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Aivanov_scan_ogc/pipeline/extract.py
Dom 7d45018139 feat(extract): normaliser ghs_injustifie en 0/1 (P2)
Qwen renvoie typiquement le libellé complet `0 SE 1 2 3 4 ATU FFM FSD`
dans le champ ghs_injustifie alors qu'une seule valeur 0/1 est attendue.
Ajout de `pipeline.checkboxes.parse_ghs_injustifie` qui extrait le
premier chiffre 0/1 via regex, ou "" si illisible.

Post-traitement appliqué à chaque extraction recueil et aux 18 JSONs
V2 existants (10 fichiers corrigés en place — les 8 autres avaient
déjà ghs_injustifie absent ou vide).

Note sur les 7 cases SE1-4/ATU/FFM/FSD : zones trop petites pour être
calibrées à l'œil et aucun cas positif (`ghs_injustifie=1`) dans
l'échantillon 2018 pour valider visuellement. La détection est en
placeholder, à recalibrer sur un cas positif réel.

Co-Authored-By: Claude Opus 4.7 (1M context) <noreply@anthropic.com>
2026-04-24 15:54:16 +02:00

297 lines
11 KiB
Python

"""Orchestration d'extraction pour un dossier OGC."""
import json
import re
import time
from pathlib import Path
from PIL import Image
from .ingest import pdf_to_images
from .classify import detect_page_type, route_by_index
from .ocr_qwen import QwenVLOCR
from .prompts import (
PAGE_TYPES, PROMPT_HEADER,
SCHEMA_RECUEIL_RECODAGE, RECUEIL_RECODAGE_ZONE,
)
from .checkboxes import detect_accord_desaccord, RECUEIL_ACCORD_DESACCORD, parse_ghs_injustifie
from .validation import annotate as validate_annotate
_EMPTY_OBJ_PATTERN = re.compile(
r'\{\s*"code"\s*:\s*""\s*,\s*"position"\s*:\s*""\s*(?:,\s*"libelle"\s*:\s*""\s*)?\}',
re.DOTALL,
)
def _truncate_empty_loop(text: str, max_consecutive: int = 2) -> str:
"""Détecte et tronque les boucles d'objets vides.
GLM-OCR peut boucler sur `{"code":"", "position":"", "libelle":""}` quand
un tableau DAS ou actes est vide dans l'image. La sortie est alors
tronquée à `max_new_tokens` sans fermer le JSON → parse error.
On garde au plus `max_consecutive` objets vides puis on coupe.
"""
matches = list(_EMPTY_OBJ_PATTERN.finditer(text))
if len(matches) <= max_consecutive:
return text
# On coupe après la fin du `max_consecutive`-ième match
cut_at = matches[max_consecutive - 1].end()
return text[:cut_at]
def _close_open_json(text: str) -> str:
"""Ajoute les brackets/braces manquants pour tenter de fermer un JSON tronqué."""
# Compte les brackets non balancés en ignorant ceux entre guillemets simples/doubles
depth_brace = 0
depth_bracket = 0
in_string = False
escape = False
for c in text:
if escape:
escape = False
continue
if c == "\\":
escape = True
continue
if c == '"':
in_string = not in_string
continue
if in_string:
continue
if c == "{": depth_brace += 1
elif c == "}": depth_brace -= 1
elif c == "[": depth_bracket += 1
elif c == "]": depth_bracket -= 1
# Retirer les virgules traînantes
closed = text.rstrip().rstrip(",")
# Fermer en priorité les crochets ouverts (tableaux), puis les accolades
closed += "]" * max(0, depth_bracket)
closed += "}" * max(0, depth_brace)
return closed
def parse_json_output(raw: str) -> dict | None:
"""Tente d'extraire un JSON depuis la sortie GLM-OCR.
Stratégies successives :
1. parse direct après retrait des fences ```json
2. patch des virgules manquantes entre objets / tableaux
3. détection et troncature des boucles d'objets vides (cas fréquent sur
tableaux DAS/actes vides → boucle jusqu'à max_new_tokens)
4. fermeture des structures JSON ouvertes après troncature
"""
if not raw:
return None
text = raw.strip()
# 1) fences markdown
text = re.sub(r"^```(?:json)?\s*", "", text)
text = re.sub(r"\s*```$", "", text)
try:
return json.loads(text)
except json.JSONDecodeError:
pass
# 2) virgules manquantes entre `} {` et `] [`
patched = re.sub(r"\}\s*\n(\s*\{)", r"},\n\1", text)
patched = re.sub(r"\]\s*\n(\s*\[)", r"],\n\1", patched)
try:
return json.loads(patched)
except json.JSONDecodeError:
pass
# 3) troncature des boucles d'objets vides puis 4) fermeture
trimmed = _truncate_empty_loop(patched)
closed = _close_open_json(trimmed)
try:
result = json.loads(closed)
result["_truncated_loop"] = True # trace de l'intervention
return result
except json.JSONDecodeError as e:
return {"_raw": raw, "_parse_error": str(e)}
def _extract_recodage_crop(image_path: Path, ocr: QwenVLOCR) -> dict | None:
"""Second passage VLM sur le crop zonal de la colonne Recodage.
Qwen nous renvoie la liste brute de tous les codes visibles (avec position
si présente). On classifie DP/DR/DAS en Python par règles :
- les 1ᵉʳ et 2ᵉ codes SANS position → DP puis DR (DR peut être vide si
le 2ᵉ code a déjà une position).
- tous les codes AVEC position → DAS.
Retourne un dict {dp, dr, das[]} ou None en cas d'échec.
"""
try:
img = Image.open(image_path)
w, h = img.size
x1, y1, x2, y2 = RECUEIL_RECODAGE_ZONE
crop = img.crop((int(x1 * w), int(y1 * h), int(x2 * w), int(y2 * h)))
crop_path = image_path.parent / f"{image_path.stem}_recodage.png"
crop.save(crop_path)
except Exception:
return None
res = ocr.run(crop_path, SCHEMA_RECUEIL_RECODAGE, max_new_tokens=1024)
parsed = parse_json_output(res["text"])
if not isinstance(parsed, dict) or "_parse_error" in parsed:
return None
# Filtrer : ne garder que les codes au format CIM-10. Si le crop dépasse
# malgré tout dans la zone Actes, les CCAM (4 lettres + 3 chiffres) seront
# exclus ici.
cim10_re = re.compile(r"^[A-Z]\d{2,4}\s*\*?\s*\+?\d*$")
codes_raw = parsed.get("codes") or []
codes = []
for c in codes_raw:
if not isinstance(c, dict): continue
code = (c.get("code") or "").strip()
if code and cim10_re.match(code):
codes.append({
"code": code,
"position": str(c.get("position") or "").strip(),
})
# Classifier par règle métier :
# - 1er code sans position → DP
# - 2e code sans position → DR (sauf s'il est identique au DP : Qwen tend
# à dupliquer le DP quand DR est vide — on préfère DR="")
# - codes avec position → DAS
dp, dr = "", ""
das = []
dp_assigned = dr_assigned = False
for c in codes:
code, position = c["code"], c["position"]
if not position:
if not dp_assigned:
dp, dp_assigned = code, True
elif not dr_assigned:
if code == dp:
# doublon du DP → on considère que DR est vide
dr_assigned = True
else:
dr, dr_assigned = code, True
else:
das.append({"code": code, "position": ""})
else:
das.append(c)
return {
"dp": dp, "dr": dr, "das": das,
"_source": "crop_recodage",
"_elapsed_s": round(res["elapsed_s"], 2),
"_n_codes_raw": len(codes_raw),
"_n_codes_kept": len(codes),
}
def _merge_codage_reco(parsed: dict, reco: dict) -> None:
"""Fusionne le résultat du crop Recodage dans parsed["codage_reco"].
Politique : le crop est plus fiable (contexte isolé), il prime sur le
passage principal SAUF si le crop laisse vide un champ que le principal
avait bien lu.
"""
existing = parsed.get("codage_reco") if isinstance(parsed.get("codage_reco"), dict) else {}
merged = {
"dp": reco.get("dp", "") or existing.get("dp", ""),
"dr": reco.get("dr", "") or existing.get("dr", ""),
"das": reco.get("das") or existing.get("das") or [],
}
parsed["codage_reco"] = merged
parsed.setdefault("_crop_recodage", {})["result"] = reco
def extract_dossier(pdf_path: str | Path, verbose: bool = True,
use_standard_routing: bool = True) -> dict:
"""Pipeline complet d'un dossier : PDF → JSON structuré.
use_standard_routing=True (défaut) : route les pages par index selon
l'ordre standard OGC (6 pages), sans OCR de classification. -50% du temps.
Vérifie uniquement la page 1 pour s'assurer qu'on commence bien par
"recueil" — si non, bascule en classification complète (fallback).
"""
pdf_path = Path(pdf_path)
ocr = QwenVLOCR()
if verbose:
print(f"[{pdf_path.name}] modèle prêt, VRAM={ocr.vram_gb:.2f} Go")
images = pdf_to_images(str(pdf_path))
if verbose:
print(f"[{pdf_path.name}] {len(images)} pages converties")
# Choix de stratégie de routing
page_types = [None] * len(images)
headers = [""] * len(images)
if use_standard_routing:
# Vérif rapide sur la page 1 (seul OCR de classification)
ptype1, header1 = detect_page_type(images[0], ocr)
if ptype1 == "recueil":
page_types = route_by_index(len(images))
headers[0] = header1
if verbose:
print(f" routing standard (page 1 = recueil OK)")
else:
if verbose:
print(f" page 1 = {ptype1} → fallback classification")
use_standard_routing = False
result = {
"fichier": pdf_path.stem,
"pdf_hash": images[0].parent.name,
"pages": [],
"extraction": {},
}
for idx, img_path in enumerate(images, 1):
t0 = time.time()
if use_standard_routing:
ptype = page_types[idx - 1]
header_text = headers[idx - 1]
else:
ptype, header_text = detect_page_type(img_path, ocr)
page_info = {
"page": idx,
"type": ptype,
"header": header_text.strip(),
"elapsed_s": None,
}
if verbose:
print(f" p{idx}: {ptype}")
prompt_conf = PAGE_TYPES.get(ptype)
if prompt_conf and prompt_conf["prompt"] != PROMPT_HEADER:
res = ocr.run(img_path, prompt_conf["prompt"], max_new_tokens=4096)
parsed = parse_json_output(res["text"])
page_info["ocr_raw"] = res["text"]
page_info["parsed"] = parsed
page_info["elapsed_s"] = round(res["elapsed_s"], 2)
# Enrichissement : checkboxes + normalisation champs booléens
# sur la fiche recueil. GLM-OCR / Qwen ne lisent pas les cases
# à cocher (cf. scratch/test_prompt_crop_v2.py).
if ptype == "recueil" and isinstance(parsed, dict):
cb = detect_accord_desaccord(img_path, RECUEIL_ACCORD_DESACCORD)
parsed["accord_desaccord"] = cb["decision"]
parsed["_checkbox_debug"] = cb # ratios + diff pour audit
# ghs_injustifie : Qwen renvoie parfois "0 SE 1 2 3 4 ATU FFM FSD"
# → ne garder que le chiffre 0/1 de tête
parsed["ghs_injustifie"] = parse_ghs_injustifie(parsed.get("ghs_injustifie", ""))
# Second passage : crop de la colonne Recodage pour compenser
# la sous-extraction observée sur codage_reco.* en passage principal.
reco = _extract_recodage_crop(img_path, ocr)
if reco:
_merge_codage_reco(parsed, reco)
page_info["parsed"] = parsed
# Indexer par type pour accès direct dans result["extraction"]
result["extraction"][ptype] = parsed
else:
# Pages non structurées : juste l'en-tête déjà OCR
page_info["elapsed_s"] = round(time.time() - t0, 2)
result["pages"].append(page_info)
# Post-traitement : validation ATIH de tous les codes extraits
result = validate_annotate(result)
return result