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- BIO_NORMALS passe de 13 à 33 tests (cardio, infectio, métabo, thyroïde, hémato, hépatique) - _BIO_INTERPRETATION synchronisé (33 entrées, 3 clés high/low/normal chacune) - _DAS_BIO_CHECKS étendu de 13 à 38 patterns (sepsis, infarctus, EP, diabète, thyroïde, etc.) - lab_value_sanity.yaml étendu avec 20 garde-fous plausibilité nouveaux tests - tests/test_bio_normals.py : 32 tests (complétude, concordance, _is_abnormal) Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
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2.3 KiB
YAML
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# Garde-fous de parsing des valeurs biologiques
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# ------------------------------------------------
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# Objectif: éviter des faux positifs dus à des artefacts PDF/OCR
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# (ex: "8" au lieu de "4.8" pour le potassium).
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#
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# IMPORTANT:
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# - Ce fichier ne définit PAS des "normes biologiques" (ça c'est reference_ranges.yaml)
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# - Ici on définit des bornes *plausibles* très larges + quelques heuristiques "anti-OCR".
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#
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# Clés des tests: minuscules, sans accents, ex: potassium, sodium, plaquettes, hemoglobine...
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version: 1
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policy:
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drop_out_of_range: true # écarte les valeurs hors bornes plausibles du dossier
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keep_suspect: true # conserve les valeurs suspectes (audit) mais les règles privilégient les valeurs ok
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tests:
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potassium:
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hard_min: 0.5
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hard_max: 9.0
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suspect:
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single_digit_over: 6.0 # "8" seul est souvent une décimale perdue (4,8 -> 8)
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sodium:
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hard_min: 90
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hard_max: 200
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plaquettes:
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hard_min: 5
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hard_max: 2000
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hemoglobine:
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hard_min: 3
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hard_max: 25
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creatinine:
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hard_min: 1
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hard_max: 5000
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crp:
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hard_min: 0
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hard_max: 1000
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alat:
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hard_min: 0
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hard_max: 5000
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asat:
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hard_min: 0
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hard_max: 5000
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ggt:
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hard_min: 0
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hard_max: 5000
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pal:
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hard_min: 0
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hard_max: 5000
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bilirubine totale:
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hard_min: 0
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hard_max: 2000
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# --- Nouveaux tests (Phase 5) ---
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bilirubine directe:
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hard_min: 0
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hard_max: 1000
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ldh:
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hard_min: 0
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hard_max: 10000
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vs:
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hard_min: 0
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hard_max: 200
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tp:
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hard_min: 0
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hard_max: 150
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tca:
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hard_min: 10
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hard_max: 200
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ferritine:
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hard_min: 0
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hard_max: 100000 # surcharge massive possible (hémochromatose)
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uree:
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hard_min: 0
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hard_max: 200
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troponine:
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hard_min: 0
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hard_max: 1000
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bnp:
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hard_min: 0
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hard_max: 50000
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nt-probnp:
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hard_min: 0
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hard_max: 100000
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d-dimeres:
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hard_min: 0
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hard_max: 100000
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inr:
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hard_min: 0.1
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hard_max: 20
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fibrinogene:
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hard_min: 0
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hard_max: 20
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procalcitonine:
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hard_min: 0
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hard_max: 1000
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lactate:
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hard_min: 0
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hard_max: 30
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glycemie:
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hard_min: 0
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hard_max: 100
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hba1c:
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hard_min: 2
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hard_max: 20
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albumine:
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hard_min: 0
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hard_max: 100
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acide urique:
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hard_min: 0
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hard_max: 2000
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tsh:
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hard_min: 0
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hard_max: 500
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