dom 4e2b4bd946 refactor: réorganisation référentiels, nouveaux modules extraction, nettoyage code obsolète ...

- Réorganisation data/referentiels/ : pdfs/, dicts/, user/ (structure unifiée)
- Fix badges "Source absente" sur page admin référentiels
- Ré-indexation COCOA 2025 (555 → 1451 chunks, couverture 94%)
- Fix VRAM OOM : embeddings forcés CPU via T2A_EMBED_CPU
- Nouveaux modules : document_router, docx_extractor, image_extractor, ocr_engine
- Module complétude (quality/completude.py + config YAML)
- Template DIM (synthèse dimensionnelle)
- Gunicorn config + systemd service t2a-viewer
- Suppression t2a_install_rag_cleanup/ (copie obsolète)
- Suppression scripts/ et scripts_t2a_v2/ (anciens benchmarks)
- Suppression 81 fichiers _doc.txt de test
- Cache Ollama : TTL configurable, corrections loader YAML
- Dashboard : améliorations templates (base, index, detail, cpam, validation)

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>

2026-03-07 16:48:10 +01:00

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resources

feat: alias diagnostiques CIM-10 + scoring conclusion + garde-fou Trackare R-code

2026-02-24 14:35:15 +01:00

__init__.py

feat: pipeline T2A - anonymisation, extraction CIM-10 et intégration edsnlp

2026-02-10 15:24:12 +01:00

conftest.py

feat: méthode TIM experte CPAM + moteur de règles étendu

2026-03-04 11:57:07 +01:00

test_anonymization.py

feat: anonymisation qualité++ — 15 patterns, subparts tirets, fix entity registry

2026-03-03 11:11:47 +01:00

test_atih_rules.py

refactor: réorganisation référentiels, nouveaux modules extraction, nettoyage code obsolète

2026-03-07 16:48:10 +01:00

test_bio_normals.py

feat: BIO_NORMALS 33 analytes + interprétations cliniques + cohérence DAS/bio étendue

2026-02-20 11:00:53 +01:00

test_ccam_dict.py

feat: dictionnaire CCAM complet (8 257 codes) + index FAISS enrichi + validation actes

2026-02-11 11:41:39 +01:00

test_ccam_noncumul.py

feat: Phase 4 — viewer enrichi, non-cumul CCAM, fusion multi-PDFs + rebuild FAISS (21 141 vecteurs)

2026-02-11 12:43:34 +01:00

test_cim10_supplements.py

fix: filtre DAS=DP + correction D55.9→D64.9 + enrichissement supplements CIM-10

2026-02-13 14:03:10 +01:00

test_clinical_context.py

feat: résumé clinique enrichi + preuves cliniques + validation QC batch

2026-02-17 21:47:27 +01:00

test_completude.py

refactor: réorganisation référentiels, nouveaux modules extraction, nettoyage code obsolète

2026-03-07 16:48:10 +01:00

test_cpam_parser.py

feat: cache Ollama + parallélisation ThreadPool + filtrage DAS renforcé + modules GHM/CPAM/export RUM

2026-02-12 13:44:34 +01:00

test_cpam_response.py

refactor: réorganisation référentiels, nouveaux modules extraction, nettoyage code obsolète

2026-03-07 16:48:10 +01:00

test_das_filter.py

feat: CODE_CORRECTIONS 12 règles déterministes + sentinel REJECT

2026-02-20 11:01:06 +01:00

test_das_llm.py

feat: enrichissement CIM-10 sous-codes + normes biologiques dans prompt DAS

2026-02-12 23:46:42 +01:00

test_decision_engine.py

feat: qualité DP Phase 2 — filtre OCR étendu, abréviations médicales, promotion DAS→DP

2026-02-20 08:37:10 +01:00

test_dp_finalizer.py

tests: dp_finalizer — 20 tests R1-R5 + pass-through + quality_flags + sérialisation

2026-02-24 17:50:32 +01:00

test_dp_selector.py

tests: alias DLBCL + garde-fou Trackare + e2e PDFs réels + gold CRH + benchmark enrichi

2026-02-24 14:35:57 +01:00

test_e2e_real_crh_pdf.py

tests: alias DLBCL + garde-fou Trackare + e2e PDFs réels + gold CRH + benchmark enrichi

2026-02-24 14:35:57 +01:00

test_exclusion_rules.py

feat: règles métier T2A Phase 1 — exclusions diagnostiques, sévérité CMA et alertes codage

2026-02-11 08:53:14 +01:00

test_extraction_multiformat.py

refactor: réorganisation référentiels, nouveaux modules extraction, nettoyage code obsolète

2026-03-07 16:48:10 +01:00

test_extraction.py

tests: CRH sections + DP diag bonus + case 74 regression + fusion propagation

2026-02-24 13:28:54 +01:00

test_fusion.py

tests: CRH sections + DP diag bonus + case 74 regression + fusion propagation

2026-02-24 13:28:54 +01:00

test_ghm.py

feat: cache Ollama + parallélisation ThreadPool + filtrage DAS renforcé + modules GHM/CPAM/export RUM

2026-02-12 13:44:34 +01:00

test_gold_debug_report.py

chore: add .gitignore

2026-03-05 00:37:41 +01:00

test_gold_eval.py

chore: add .gitignore

2026-03-05 00:37:41 +01:00

test_integration.py

feat: pipeline T2A - anonymisation, extraction CIM-10 et intégration edsnlp

2026-02-10 15:24:12 +01:00

test_justification.py

feat: résumé clinique enrichi + preuves cliniques + validation QC batch

2026-02-17 21:47:27 +01:00

test_medical.py

feat: traçabilité source systématique + viewer interactif

2026-02-18 20:59:50 +01:00

test_nutrition_has2021_integration.py

refactor: réorganisation référentiels, nouveaux modules extraction, nettoyage code obsolète

2026-03-07 16:48:10 +01:00

test_nutrition_has2021.py

refactor: réorganisation référentiels, nouveaux modules extraction, nettoyage code obsolète

2026-03-07 16:48:10 +01:00

test_ollama_cache.py

feat: architecture multi-modèles LLM + quality engine + benchmark

2026-02-20 00:21:09 +01:00

test_ollama_client.py

fix: réparation JSON tronqué + retry 429 + whitelist codes CPAM anti-hallucination

2026-02-20 13:33:39 +01:00

test_p0_patches.py

chore: add .gitignore

2026-03-05 00:37:41 +01:00

test_p1_lite.py

chore: add .gitignore

2026-03-05 00:37:41 +01:00

test_page_tracker.py

feat: mode hybride Ollama — gemma3:27b pour CPAM, 12b pour codage

2026-02-17 17:53:53 +01:00

test_rag.py

feat: 3 quick wins — source DAS, fallback code parent, filtre anatomique

2026-02-15 11:34:32 +01:00

test_referentiels.py

feat: pass LLM hybride pour DAS + interface admin référentiels RAG

2026-02-12 23:12:39 +01:00

test_rum_export.py

feat: cache Ollama + parallélisation ThreadPool + filtrage DAS renforcé + modules GHM/CPAM/export RUM

2026-02-12 13:44:34 +01:00

test_severity.py

feat: mode hybride Ollama — gemma3:27b pour CPAM, 12b pour codage

2026-02-17 17:53:53 +01:00

test_splitter.py

refactor: réorganisation référentiels, nouveaux modules extraction, nettoyage code obsolète

2026-03-07 16:48:10 +01:00

test_viewer.py

refactor: réorganisation référentiels, nouveaux modules extraction, nettoyage code obsolète

2026-03-07 16:48:10 +01:00