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dom
fc68fc6f6b feat: traitement des sous-dossiers patients avec sorties miroir
Permet d'organiser les PDFs en sous-répertoires (un niveau) dans le
dossier d'entrée. Les sorties reflètent cette structure dans output/.
Les PDFs à la racine continuent de fonctionner comme avant.

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-02-10 18:45:09 +01:00
dom
4d6fbef2b9 feat: ajout RAG CIM-10 avec FAISS + Ollama
Implémente un système RAG (Retrieval Augmented Generation) qui indexe
les documents de référence ATIH (CIM-10 FR 2026, Guide Métho MCO,
CCAM PMSI) et utilise Ollama (mistral-small3.2:24b) pour justifier
et valider le codage CIM-10 des diagnostics.

- Nouveaux modèles Pydantic : RAGSource, Diagnostic étendu (confidence,
  justification, sources_rag) — rétrocompatible
- Module rag_index.py : chunking des 3 PDFs, embedding sentence-camembert-large,
  index FAISS IndexFlatIP (3630 vecteurs)
- Module rag_search.py : recherche FAISS + appel Ollama avec fallback double
- Flag CLI --no-rag pour désactiver l'enrichissement RAG
- 18 nouveaux tests (88/88 passent)

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-02-10 17:47:08 +01:00
dom
4a12cd2676 feat: pipeline T2A - anonymisation, extraction CIM-10 et intégration edsnlp
Pipeline complet de traitement de documents médicaux PDF :
- Extraction texte (pdfplumber) et classification (Trackare/CRH)
- Anonymisation multi-couche (regex + NER CamemBERT + sweep)
- Extraction médicale CIM-10 hybride : edsnlp (AP-HP) enrichit les
  diagnostics, médicaments (codes ATC via Romedi) et négation,
  avec fallback regex pour les patterns spécifiques
- Fix sentencepiece pinné à <0.2.0 pour compatibilité CamemBERT

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-02-10 15:24:12 +01:00