Permet d'organiser les PDFs en sous-répertoires (un niveau) dans le
dossier d'entrée. Les sorties reflètent cette structure dans output/.
Les PDFs à la racine continuent de fonctionner comme avant.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
Pipeline complet de traitement de documents médicaux PDF :
- Extraction texte (pdfplumber) et classification (Trackare/CRH)
- Anonymisation multi-couche (regex + NER CamemBERT + sweep)
- Extraction médicale CIM-10 hybride : edsnlp (AP-HP) enrichit les
diagnostics, médicaments (codes ATC via Romedi) et négation,
avec fallback regex pour les patterns spécifiques
- Fix sentencepiece pinné à <0.2.0 pour compatibilité CamemBERT
Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>