refactor: réorganisation référentiels, nouveaux modules extraction, nettoyage code obsolète
- Réorganisation data/referentiels/ : pdfs/, dicts/, user/ (structure unifiée) - Fix badges "Source absente" sur page admin référentiels - Ré-indexation COCOA 2025 (555 → 1451 chunks, couverture 94%) - Fix VRAM OOM : embeddings forcés CPU via T2A_EMBED_CPU - Nouveaux modules : document_router, docx_extractor, image_extractor, ocr_engine - Module complétude (quality/completude.py + config YAML) - Template DIM (synthèse dimensionnelle) - Gunicorn config + systemd service t2a-viewer - Suppression t2a_install_rag_cleanup/ (copie obsolète) - Suppression scripts/ et scripts_t2a_v2/ (anciens benchmarks) - Suppression 81 fichiers _doc.txt de test - Cache Ollama : TTL configurable, corrections loader YAML - Dashboard : améliorations templates (base, index, detail, cpam, validation) Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
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@@ -202,6 +202,9 @@ def _extract_biologie(text: str, dossier: DossierMedical) -> None:
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(r"(?:[Gg]lyc[ée]mie|[Gg]lucose)\s*[=:àa]?\s*(\d+(?:[.,]\d+)?)\s*(?:mmol/L|g/L)?", "Glycémie"),
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(r"\bHbA1c\b\s*[=:àa]?\s*(\d+(?:[.,]\d+)?)\s*(?:%)?", "HbA1c"),
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(r"\bTSH\b\s*[=:àa]?\s*(\d+(?:[.,]\d+)?)\s*(?:mUI/L)?", "TSH"),
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# Albumine / Préalbumine (critère de sévérité HAS 2021 dénutrition)
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(r"(?:[Aa]lbumin[ée]?(?:mie)?|[Aa]lb(?:u)?[ée]?(?:mie)?)\s*[=:àa]?\s*(\d+(?:[.,]\d+)?)\s*(?:g/[Ll])?", "Albumine"),
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(r"(?:[Pp]r[ée]albumine|[Tt]ransthyr[ée]tine)\s*[=:àa]?\s*(\d+(?:[.,]\d+)?)\s*(?:mg/[Ll]|g/[Ll])?", "Préalbumine"),
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