refactor: réorganisation référentiels, nouveaux modules extraction, nettoyage code obsolète

- Réorganisation data/referentiels/ : pdfs/, dicts/, user/ (structure unifiée)
- Fix badges "Source absente" sur page admin référentiels
- Ré-indexation COCOA 2025 (555 → 1451 chunks, couverture 94%)
- Fix VRAM OOM : embeddings forcés CPU via T2A_EMBED_CPU
- Nouveaux modules : document_router, docx_extractor, image_extractor, ocr_engine
- Module complétude (quality/completude.py + config YAML)
- Template DIM (synthèse dimensionnelle)
- Gunicorn config + systemd service t2a-viewer
- Suppression t2a_install_rag_cleanup/ (copie obsolète)
- Suppression scripts/ et scripts_t2a_v2/ (anciens benchmarks)
- Suppression 81 fichiers _doc.txt de test
- Cache Ollama : TTL configurable, corrections loader YAML
- Dashboard : améliorations templates (base, index, detail, cpam, validation)

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>

config/diagnostic_conflicts.yaml

@@ -26,9 +26,9 @@ mutual_exclusions:
 
 incompatibilities:
   - pair: ["E66", "E40", "E41", "E42", "E43", "E44", "E45", "E46"]
-    atih_ref: "Guide Méthodologique MCO : Incompatibilité clinique Obésité / Dénutrition"
-    message: "Obésité (E66) et Dénutrition/Malnutrition (E40-E46) sont cliniquement incompatibles"
-    severity: "HARD"
+    atih_ref: "HAS/FFN nov 2021 : un patient obèse peut être dénutri"
+    message: "Obésité et Dénutrition coexistent — vérifier critères HAS 2021 (perte de poids, sarcopénie, albumine)"
+    severity: "MEDIUM"
 
   - pair: ["I10", "I95"]
     atih_ref: "Guide Méthodologique MCO : Incohérence Hypertension / Hypotension sur le même séjour"