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anonymisation/data/silver_annotations/CRO 23159905.bio
Domi31tls 26b210607c feat(phase2): Gazetteers FINESS 102K établissements + fine-tuning CamemBERT-bio F1=89%
Gazetteers FINESS (data.gouv.fr open data):
- 102K numéros FINESS → détection par lookup exact dans _mask_admin_label + selective_rescan
- 122K noms d'établissements, 113K téléphones, 76K adresses (disponibles)
- Un nombre 9 chiffres matchant un vrai FINESS est masqué même sans label "FINESS"

Fine-tuning CamemBERT-bio (almanach/camembert-bio-base):
- Export silver annotations réécrit : alignement original↔pseudonymisé (difflib)
  → 6862 entités B- (vs 3344 avec l'ancien audit-only) sur 222K tokens
- Sliding windows (200 tokens, stride 100) pour documents longs
- WeightedNERTrainer avec class weights cappés (max 10x) + label smoothing
- Résultat: Precision=88.1%, Recall=89.8%, F1=88.9% (20 epochs, lr=1e-5)
- Modèle sauvegardé dans models/camembert-bio-deid/best (non commité)

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-03-09 13:27:37 +01:00

503 lines
5.0 KiB
Plaintext
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CROp O
Epi B-PER
- O
COSSU, B-PER
REMI I-PER
_______________________________________________________________________________________________________________ O
Compte O
rendu O
opératoire O
>>>CRO O
neurochirurgie O
type O
22/08/23 O
14:31 O
(mod. O
le O
22/08/23 O
14:58 O
par O
ARTIGUEBIEILLE B-PER
Veronique I-PER
, O
statut O
Réf O
: O
JF/VA O
Bayonne, O
le O
22/08/2023 O
Dr O
Maria B-PER
BISCAY-SALLABERRY I-PER
CABINET O
ETXEBARNONDOA B-PER
Le O
BOURG O
64780 B-ZIP
IRISSARRY I-ZIP
Mr O
REMI B-PER
COSSU I-PER
200 B-ADRESSE
CHEMIN I-ADRESSE
SORHABIETA B-ZIP
64640 I-ZIP
IHOLDY I-ZIP
Madame O
et O
cher O
confrère, O
Je O
vous O
remercie O
de O
bien O
vouloir O
trouver O
ci-joint O
le O
compte-rendu O
opératoire O
concernant O
votre O
patient, O
Mr O
R O
le O
07/08/1999. O
En O
vous O
remerciant O
de O
votre O
confiance, O
Je O
vous O
prie O
de O
croire, O
Madame O
et O
cher O
confrère, O
à O
lexpression O
de O
mes O
sentiments O
confraternellement O
dé O
Docteur O
Joe B-PER
FADDOUL I-PER
Courrier O
lu O
et O
validé O
par O
le O
médecin O
COMPTE O
RENDU O
OPÉRATOIRE O
Date O
: O
22/08/2023 O
Dossier O
: O
23159905 O
Nom O
: O
COSSU B-PER
Prénom O
: O
REMI B-PER
Date O
de O
naissance O
: O
07/08/1999 B-DATE_NAISSANCE
Service O
: O
Neurochirurgie O
CHIRURGIEN O
: O
Dr O
FADDOUL B-PER
Joe I-PER
AIDE O
OPERATOIRE O
: O
STEFANINI B-PER
Andréa I-PER
ANESTHÉSISTE O
: O
Dr O
CUCUPHAT B-PER
Pierre-Lou I-PER
INTERVENTION O
PRATIQUÉE O
: O
ABLATION O
DUN O
SITE O
DACCES O
INTRATHECAL O
POUR O
DES O
TESTS O
A O
BACLOFENE. O
HISTOIRE O
DE O
LA O
MALADIE O
: O
Mr O
COSSU O
Rémi, O
né O
le O
07/08/1999, O
qui O
est O
connu O
pour O
avoir O
une O
tétraparésie O
spastique O
suite O
à O
une O
contusion O
_______________________________________________________________________________________________________________ O
Information O
patient O
Page O
1 O
18/04/2025 O
11:54:37 O
CROp O
Epi B-PER
- O
COSSU, B-PER
REMI I-PER
_______________________________________________________________________________________________________________ O
Compte O
rendu O
opératoire O
est O
porteur O
depuis O
trois O
semaines O
dun O
site O
daccès O
intrathécal O
pour O
des O
tests O
à O
Baclofène. O
Lintervention O
sétait O
déroulée O
sans O
complication O
particulière O
et O
Mr O
COSSU B-PER
était O
hospitalisé O
à O
MARIENIA B-PER
depui O
pour O
réaliser O
les O
tests O
nécessaires. O
Il O
a O
présenté O
une O
déhiscence O
de O
la O
cicatrice O
thoraco-lombaire O
avec O
le O
cathéter O
intrathécal O
qui O
était O
exposé O
à O
la O
Après O
discussion O
collégiale O
avec O
nos O
collègues O
MPR, O
Dr O
BEGUE B-PER
à O
MARIENIA, O
Mr O
COSSU B-PER
a O
été O
transféré O
dan O
neurochirurgie O
pour O
ablation O
du O
site O
daccès O
intrathécal, O
surtout O
que O
lexposition O
à O
lair O
libre O
du O
cathéter O
intrathé O
risque O
important O
dinfection O
à O
type O
de O
méningite. O
Les O
avantages O
de O
cette O
intervention O
ainsi O
que O
le O
risque O
de O
complication O
ont O
été O
bien O
expliqués O
à O
Mr O
COSSU B-PER
qu O
geste O
chirurgical. O
Protocole O
opératoire O
: O
Anesthésie O
générale, O
position O
en O
décubitus O
latéral O
gauche, O
vérification O
des O
points O
dappuis O
après O
intubation O
oro O
Vérification O
des O
points O
dappui. O
Préparation O
de O
la O
peau O
selon O
le O
protocole O
habitue O
à O
la O
Bétadine O
scrub O
et O
réalisation O
de O
badigeons O
à O
la O
Bétadin O
Mise O
en O
place O
des O
champs O
en O
condition O
stérile. O
Reprise O
de O
la O
cicatrice O
para-ombilicale O
droite. O
Dissection O
sous-cutanée O
jusquà O
identification O
du O
réservoir. O
Exté O
ce O
réservoir. O
Reprise O
de O
la O
cicatrice O
thoraco-lombaire O
qui O
était O
inflammatoire O
sur O
ses O
berges O
et O
exposition O
du O
cathéter O
intrath O
déjà O
exposé O
à O
lair O
libre O
en O
partie. O
On O
enlève O
le O
fixateur O
aponévrotique O
du O
cathéter O
et O
on O
sectionne O
le O
cathéter O
intrathécal O
pour O
avoir O
quelques O
cc O
envoyés O
en O
étude O
bactériologique. O
Ablation O
de O
la O
partie O
intrathécale O
de O
ce O
cathéter O
qui O
a O
été O
envoyée O
à O
son O
tour O
à O
létude O
bactériologique. O
Ablation O
du O
réservoir O
avec O
le O
cathéter O
correspondant. O
Avivement O
des O
berges O
de O
la O
cicatrice O
thoraco-lombaire O
jusquà O
avoir O
un O
retour O
sanguin O
suffisant O
et O
fermeture O
d O
laide O
de O
fil O
à O
peau O
en O
Blair O
Donati. O
Fermeture O
de O
lincision O
para-ombilicale O
droite O
à O
laide O
de O
fil O
à O
peau O
en O
points O
séparés O
Blair O
Donati. O
Durée O
de O
lintervention O
: O
15 O
mn O
Perte O
sanguine O
: O
négligeable, O
non O
compensée O
Docteur O
Joe B-PER
FADDOUL I-PER
Courrier O
lu O
et O
validé O
par O
le O
médecin O
_______________________________________________________________________________________________________________ O
Information O
patient O
Page O
2 O
18/04/2025 O
11:54:37 O