feat(phase2): Fine-tuning CamemBERT-bio v2 (F1=0.90) + enrichissement données
- Fine-tuning camembert-bio-base : F1=0.903, Recall=0.930 (vs 0.89/0.85) - Data augmentation : substitution noms INSEE (219K patronymes, x3 copies) - Hard negatives BDPM (5.7K médicaments) + QUAERO (1319 termes médicaux) - Annotations silver enrichies par gazetteers (+612 VILLE, +5 HOPITAL) - Export silver avec support multi-répertoires (--extra-dir) - Gazetteers QUAERO : CHEM, DISO, PROC, ANAT depuis DrBenchmark/QUAERO - Gazetteers INSEE : noms de famille fréquents (96K) et complets (219K) - Batch silver 1194 PDFs (run_batch_silver_export.py) pour dataset v3 Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
This commit is contained in:
@@ -59,14 +59,14 @@ Code O
|
||||
Postal: O
|
||||
64100 B-ZIP
|
||||
Adresse: O
|
||||
LOT B-VILLE
|
||||
VALADOUR I-VILLE
|
||||
LOT O
|
||||
VALADOUR O
|
||||
- O
|
||||
6 B-ADRESSE
|
||||
ALLEE I-ADRESSE
|
||||
DE I-ADRESSE
|
||||
SEGURE I-ADRESSE
|
||||
Ville O
|
||||
Ville B-VILLE
|
||||
de O
|
||||
résidence: O
|
||||
BAYONNE B-VILLE
|
||||
@@ -137,8 +137,8 @@ de O
|
||||
confiance O
|
||||
Epouse B-PER
|
||||
ETCHEVERRY I-PER
|
||||
Josette I-PER
|
||||
0612152063 B-TEL
|
||||
Josette B-TEL
|
||||
0612152063 I-TEL
|
||||
Antécédents O
|
||||
et O
|
||||
habitudes O
|
||||
@@ -156,7 +156,7 @@ Note O
|
||||
Aucune O
|
||||
donnée O
|
||||
renseignée O
|
||||
Signes O
|
||||
Signes B-VILLE
|
||||
Vitaux O
|
||||
Item O
|
||||
de O
|
||||
@@ -747,7 +747,7 @@ arrêt O
|
||||
AOD O
|
||||
pour O
|
||||
RTV. O
|
||||
Aucun O
|
||||
Aucun B-VILLE
|
||||
incident O
|
||||
per O
|
||||
opératoire O
|
||||
@@ -815,15 +815,15 @@ surveillance O
|
||||
01/03/2023 O
|
||||
18:00 O
|
||||
01/03/2023 O
|
||||
20:50 B-DATE_NAISSANCE
|
||||
02/03/2023 I-DATE_NAISSANCE
|
||||
00:26 I-DATE_NAISSANCE
|
||||
02/03/2023 I-DATE_NAISSANCE
|
||||
05:14 I-DATE_NAISSANCE
|
||||
02/03/2023 I-DATE_NAISSANCE
|
||||
08:36 I-DATE_NAISSANCE
|
||||
02/03/2023 I-DATE_NAISSANCE
|
||||
15:07 I-DATE_NAISSANCE
|
||||
20:50 O
|
||||
02/03/2023 O
|
||||
00:26 O
|
||||
02/03/2023 O
|
||||
05:14 O
|
||||
02/03/2023 O
|
||||
08:36 O
|
||||
02/03/2023 O
|
||||
15:07 O
|
||||
03/03/2023 O
|
||||
00:22 O
|
||||
03/03/2023 O
|
||||
@@ -892,7 +892,7 @@ Normal O
|
||||
Absence O
|
||||
Gaz O
|
||||
+ O
|
||||
selles O
|
||||
selles B-VILLE
|
||||
Notes O
|
||||
paramédicales O
|
||||
Type O
|
||||
@@ -961,11 +961,11 @@ SV O
|
||||
demain O
|
||||
Note O
|
||||
IDE O
|
||||
Agnes B-PER
|
||||
Agnes O
|
||||
SAINT- O
|
||||
GERMES O
|
||||
02/03/2023 B-DATE_NAISSANCE
|
||||
15:12 I-DATE_NAISSANCE
|
||||
02/03/2023 O
|
||||
15:12 O
|
||||
HGT O
|
||||
recontrolée O
|
||||
1.77 O
|
||||
@@ -982,7 +982,7 @@ reprise O
|
||||
mictionnelle O
|
||||
, O
|
||||
avec O
|
||||
son O
|
||||
son B-VILLE
|
||||
épouse O
|
||||
, O
|
||||
ordo O
|
||||
@@ -1051,8 +1051,8 @@ Note O
|
||||
IDE O
|
||||
Camille B-PER
|
||||
COUDERC I-PER
|
||||
02/03/2023 B-DATE_NAISSANCE
|
||||
08:54 I-DATE_NAISSANCE
|
||||
02/03/2023 O
|
||||
08:54 O
|
||||
BS O
|
||||
ce O
|
||||
matin O
|
||||
@@ -1106,8 +1106,8 @@ Note O
|
||||
IDE O
|
||||
Clara B-PER
|
||||
ARGANO I-PER
|
||||
02/03/2023 B-DATE_NAISSANCE
|
||||
00:24 I-DATE_NAISSANCE
|
||||
02/03/2023 O
|
||||
00:24 O
|
||||
HGT: O
|
||||
1.46 O
|
||||
TRANSIT: O
|
||||
@@ -1118,7 +1118,7 @@ irrigations O
|
||||
en O
|
||||
cours, O
|
||||
débit O
|
||||
moyen O
|
||||
moyen B-VILLE
|
||||
=> O
|
||||
urines O
|
||||
rosées O
|
||||
@@ -1430,7 +1430,7 @@ Statut O
|
||||
des O
|
||||
prescriptions: O
|
||||
En O
|
||||
cours O
|
||||
cours B-VILLE
|
||||
Le O
|
||||
débit O
|
||||
a O
|
||||
@@ -1439,7 +1439,7 @@ modifié. O
|
||||
Le O
|
||||
débit O
|
||||
en O
|
||||
cours O
|
||||
cours B-VILLE
|
||||
est O
|
||||
: O
|
||||
41.666666666666664 O
|
||||
@@ -1448,8 +1448,8 @@ par O
|
||||
1 O
|
||||
hrs. O
|
||||
SODIUM O
|
||||
CHL O
|
||||
MACO O
|
||||
CHL B-PER
|
||||
MACO I-PER
|
||||
0,9% O
|
||||
INJ O
|
||||
PP O
|
||||
@@ -1609,8 +1609,8 @@ Juliette B-PER
|
||||
REY I-PER
|
||||
RESIKALI O
|
||||
PDR O
|
||||
SUSP O
|
||||
BUV O
|
||||
SUSP B-PER
|
||||
BUV I-PER
|
||||
OU O
|
||||
RECT O
|
||||
[25] O
|
||||
@@ -1802,8 +1802,8 @@ Signé O
|
||||
ANORO O
|
||||
55MCG/22MCG O
|
||||
PDR O
|
||||
INH O
|
||||
UNIDOSE O
|
||||
INH B-PER
|
||||
UNIDOSE I-PER
|
||||
[30] O
|
||||
RU(s) O
|
||||
1 O
|
||||
@@ -1925,7 +1925,7 @@ COQUEREL I-PER
|
||||
SOINS O
|
||||
DE O
|
||||
BOUCHE O
|
||||
MEDICAMENTEUX O
|
||||
MEDICAMENTEUX B-PER
|
||||
Signé O
|
||||
- O
|
||||
à O
|
||||
@@ -1950,9 +1950,9 @@ Normal O
|
||||
00:05 B-PER
|
||||
Celine I-PER
|
||||
COQUEREL I-PER
|
||||
BAS O
|
||||
DE O
|
||||
CONTENTION O
|
||||
BAS I-PER
|
||||
DE I-PER
|
||||
CONTENTION I-PER
|
||||
: O
|
||||
POSE O
|
||||
Réalisé O
|
||||
@@ -2096,7 +2096,7 @@ MAQUILLAGE, O
|
||||
PROTHESES, O
|
||||
VERNIS O
|
||||
A O
|
||||
ONGLES O
|
||||
ONGLES B-VILLE
|
||||
Réalisé O
|
||||
- O
|
||||
à O
|
||||
@@ -2185,7 +2185,7 @@ Page O
|
||||
5 O
|
||||
de O
|
||||
17 O
|
||||
SIGNES O
|
||||
SIGNES B-VILLE
|
||||
VITAUX O
|
||||
(Pls, O
|
||||
TA, O
|
||||
@@ -2252,7 +2252,7 @@ Page O
|
||||
6 O
|
||||
de O
|
||||
17 O
|
||||
Plan O
|
||||
Plan B-VILLE
|
||||
de O
|
||||
soins O
|
||||
Jour O
|
||||
@@ -2411,8 +2411,8 @@ En O
|
||||
cours O
|
||||
— O
|
||||
SODIUM O
|
||||
CHL O
|
||||
MACO O
|
||||
CHL B-PER
|
||||
MACO I-PER
|
||||
0,9% O
|
||||
INJ O
|
||||
PP O
|
||||
@@ -2440,8 +2440,8 @@ En O
|
||||
cours O
|
||||
— O
|
||||
SODIUM O
|
||||
CHL O
|
||||
MACO O
|
||||
CHL B-PER
|
||||
MACO I-PER
|
||||
0,9% O
|
||||
INJ O
|
||||
PP O
|
||||
@@ -3382,9 +3382,9 @@ Signé O
|
||||
— O
|
||||
RESIKALI O
|
||||
PDR O
|
||||
SUSP O
|
||||
BUV O
|
||||
OU O
|
||||
SUSP B-PER
|
||||
BUV I-PER
|
||||
OU I-PER
|
||||
RECT O
|
||||
- O
|
||||
15,18-18,98G O
|
||||
@@ -3410,9 +3410,9 @@ Signé O
|
||||
— O
|
||||
RESIKALI O
|
||||
PDR O
|
||||
SUSP O
|
||||
BUV O
|
||||
OU O
|
||||
SUSP B-PER
|
||||
BUV I-PER
|
||||
OU I-PER
|
||||
RECT O
|
||||
- O
|
||||
15,18-18,98G O
|
||||
@@ -3438,9 +3438,9 @@ Signé O
|
||||
— O
|
||||
RESIKALI O
|
||||
PDR O
|
||||
SUSP O
|
||||
BUV O
|
||||
OU O
|
||||
SUSP B-PER
|
||||
BUV I-PER
|
||||
OU I-PER
|
||||
RECT O
|
||||
- O
|
||||
15,18-18,98G O
|
||||
@@ -3938,8 +3938,8 @@ dose: O
|
||||
Réalisé O
|
||||
— O
|
||||
BAS O
|
||||
DE O
|
||||
CONTENTION O
|
||||
DE B-PER
|
||||
CONTENTION I-PER
|
||||
: O
|
||||
POSE O
|
||||
- O
|
||||
@@ -4814,7 +4814,7 @@ Page O
|
||||
11 O
|
||||
de O
|
||||
17 O
|
||||
Plan O
|
||||
Plan B-VILLE
|
||||
de O
|
||||
soins O
|
||||
Jour O
|
||||
@@ -4903,8 +4903,8 @@ En O
|
||||
cours O
|
||||
— O
|
||||
SODIUM O
|
||||
CHL O
|
||||
MACO O
|
||||
CHL B-PER
|
||||
MACO I-PER
|
||||
0,9% O
|
||||
INJ O
|
||||
PP O
|
||||
@@ -4932,8 +4932,8 @@ En O
|
||||
cours O
|
||||
— O
|
||||
SODIUM O
|
||||
CHL O
|
||||
MACO O
|
||||
CHL B-PER
|
||||
MACO I-PER
|
||||
0,9% O
|
||||
INJ O
|
||||
PP O
|
||||
@@ -5619,9 +5619,9 @@ Signé O
|
||||
— O
|
||||
RESIKALI O
|
||||
PDR O
|
||||
SUSP O
|
||||
BUV O
|
||||
OU O
|
||||
SUSP B-PER
|
||||
BUV I-PER
|
||||
OU I-PER
|
||||
RECT O
|
||||
- O
|
||||
15,18-18,98G O
|
||||
@@ -6114,8 +6114,8 @@ dose: O
|
||||
Réalisé O
|
||||
— O
|
||||
BAS O
|
||||
DE O
|
||||
CONTENTION O
|
||||
DE B-PER
|
||||
CONTENTION I-PER
|
||||
: O
|
||||
POSE O
|
||||
- O
|
||||
|
||||
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