feat(phase2): Fine-tuning CamemBERT-bio v2 (F1=0.90) + enrichissement données
- Fine-tuning camembert-bio-base : F1=0.903, Recall=0.930 (vs 0.89/0.85) - Data augmentation : substitution noms INSEE (219K patronymes, x3 copies) - Hard negatives BDPM (5.7K médicaments) + QUAERO (1319 termes médicaux) - Annotations silver enrichies par gazetteers (+612 VILLE, +5 HOPITAL) - Export silver avec support multi-répertoires (--extra-dir) - Gazetteers QUAERO : CHEM, DISO, PROC, ANAT depuis DrBenchmark/QUAERO - Gazetteers INSEE : noms de famille fréquents (96K) et complets (219K) - Batch silver 1194 PDFs (run_batch_silver_export.py) pour dataset v3 Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
This commit is contained in:
@@ -77,7 +77,7 @@ Localisation: O
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||||
CHIRURGIE O
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||||
VISCERALE O
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||||
Médecin O
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||||
courant: O
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||||
courant: B-PER
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||||
DR. O
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||||
Renaud B-PER
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||||
GONTIER I-PER
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||||
@@ -173,7 +173,7 @@ Note O
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||||
Aucune O
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||||
donnée O
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||||
renseignée O
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Signes O
|
||||
Signes B-VILLE
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vitaux O
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Item O
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||||
de O
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||||
@@ -562,7 +562,7 @@ encore O
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||||
de O
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||||
reprise O
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||||
de O
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||||
selles, O
|
||||
selles, B-VILLE
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||||
gaz O
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||||
+ O
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||||
et O
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||||
@@ -605,8 +605,8 @@ par O
|
||||
ailleurs O
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||||
Stimulée O
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||||
à O
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||||
la O
|
||||
marche O
|
||||
la B-VILLE
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||||
marche I-VILLE
|
||||
++ O
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||||
Note O
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||||
d'évolution O
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||||
@@ -626,7 +626,7 @@ retirée O
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||||
aujourd'hui O
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||||
sortie O
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||||
lundi O
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||||
vue O
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||||
vue B-VILLE
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||||
ce O
|
||||
jour O
|
||||
pour O
|
||||
@@ -1040,11 +1040,11 @@ Devenir: O
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||||
RAD O
|
||||
le O
|
||||
10/10 O
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||||
VSL O
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||||
VSL B-PER
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||||
11h30, O
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||||
frère O
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||||
au O
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||||
courant, O
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||||
courant, B-VILLE
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||||
message O
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||||
laissé O
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||||
sur O
|
||||
@@ -1068,7 +1068,7 @@ au O
|
||||
niveau O
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||||
appareillage O
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||||
socle O
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||||
changé O
|
||||
changé B-VILLE
|
||||
Devenir: O
|
||||
RAD O
|
||||
demain O
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||||
@@ -1084,7 +1084,7 @@ place O
|
||||
avec O
|
||||
gaz O
|
||||
sans O
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||||
selles O
|
||||
selles B-VILLE
|
||||
ce O
|
||||
jour O
|
||||
=>Vu O
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||||
@@ -1097,7 +1097,7 @@ gastro O
|
||||
donné O
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||||
==>Début O
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||||
de O
|
||||
selles O
|
||||
selles B-VILLE
|
||||
fin O
|
||||
de O
|
||||
matinée O
|
||||
@@ -1112,7 +1112,7 @@ début O
|
||||
de O
|
||||
nausées O
|
||||
ni O
|
||||
rots O
|
||||
rots B-VILLE
|
||||
-Ventre O
|
||||
souple O
|
||||
Infectieux: O
|
||||
@@ -1140,8 +1140,8 @@ sur O
|
||||
répondeur O
|
||||
Frère O
|
||||
au O
|
||||
courant O
|
||||
VSL O
|
||||
courant B-PER
|
||||
VSL I-PER
|
||||
ddé O
|
||||
pour O
|
||||
11h30 O
|
||||
@@ -1316,7 +1316,7 @@ des O
|
||||
gaz O
|
||||
pas O
|
||||
de O
|
||||
selles O
|
||||
selles B-VILLE
|
||||
appareillage O
|
||||
refait O
|
||||
cette O
|
||||
@@ -1329,7 +1329,7 @@ infectieux: O
|
||||
Apyrétique O
|
||||
VVP O
|
||||
en O
|
||||
place O
|
||||
place B-VILLE
|
||||
propre O
|
||||
Digestif: O
|
||||
stomie O
|
||||
@@ -1392,7 +1392,7 @@ G+ O
|
||||
et O
|
||||
traces O
|
||||
de O
|
||||
selles O
|
||||
selles B-VILLE
|
||||
liquides O
|
||||
Syndrome O
|
||||
infectieux O
|
||||
@@ -1416,7 +1416,7 @@ des O
|
||||
gaz O
|
||||
pas O
|
||||
de O
|
||||
selles O
|
||||
selles B-VILLE
|
||||
-> O
|
||||
traitement O
|
||||
débuté O
|
||||
@@ -1560,7 +1560,7 @@ de O
|
||||
vomissements, O
|
||||
pas O
|
||||
de O
|
||||
rots O
|
||||
rots B-VILLE
|
||||
Devenir: O
|
||||
- O
|
||||
vit O
|
||||
@@ -1594,7 +1594,7 @@ demain O
|
||||
de O
|
||||
nausées O
|
||||
ni O
|
||||
rots O
|
||||
rots B-VILLE
|
||||
-Ventre O
|
||||
souple O
|
||||
Infectieux: O
|
||||
@@ -1772,7 +1772,7 @@ de O
|
||||
vomissements, O
|
||||
pas O
|
||||
de O
|
||||
rots O
|
||||
rots B-VILLE
|
||||
Endocrino: O
|
||||
- O
|
||||
glycémie O
|
||||
@@ -1793,7 +1793,7 @@ Transit: O
|
||||
avec O
|
||||
baguette O
|
||||
en O
|
||||
place: O
|
||||
place: B-VILLE
|
||||
présence O
|
||||
e O
|
||||
gaz O
|
||||
@@ -1810,7 +1810,7 @@ poche O
|
||||
de O
|
||||
nausées O
|
||||
ni O
|
||||
rots O
|
||||
rots B-VILLE
|
||||
-Ventre O
|
||||
souple O
|
||||
Infectieux: O
|
||||
@@ -1843,7 +1843,7 @@ HGT O
|
||||
ok O
|
||||
Allo O
|
||||
de O
|
||||
son O
|
||||
son B-VILLE
|
||||
IDE O
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||||
libérale=>Souhaite O
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||||
RAD O
|
||||
@@ -1982,7 +1982,7 @@ au O
|
||||
niveau O
|
||||
abdo O
|
||||
à O
|
||||
son O
|
||||
son B-VILLE
|
||||
arrivée O
|
||||
avec O
|
||||
une O
|
||||
@@ -2191,7 +2191,7 @@ Flacon(s) O
|
||||
Le O
|
||||
débit O
|
||||
en O
|
||||
cours O
|
||||
cours B-VILLE
|
||||
est O
|
||||
: O
|
||||
20 O
|
||||
@@ -2233,7 +2233,7 @@ Statut O
|
||||
des O
|
||||
prescriptions: O
|
||||
En O
|
||||
cours O
|
||||
cours B-VILLE
|
||||
Le O
|
||||
débit O
|
||||
a O
|
||||
@@ -2242,7 +2242,7 @@ modifié. O
|
||||
Le O
|
||||
débit O
|
||||
en O
|
||||
cours O
|
||||
cours B-VILLE
|
||||
est O
|
||||
: O
|
||||
41.666666666666664 O
|
||||
@@ -3174,7 +3174,7 @@ MAQUILLAGE, O
|
||||
PROTHESES, O
|
||||
VERNIS O
|
||||
A O
|
||||
ONGLES O
|
||||
ONGLES B-VILLE
|
||||
Réalisé O
|
||||
- O
|
||||
à O
|
||||
@@ -3504,7 +3504,7 @@ Page O
|
||||
9 O
|
||||
de O
|
||||
18 O
|
||||
Plan O
|
||||
Plan B-VILLE
|
||||
de O
|
||||
soins O
|
||||
Jour O
|
||||
@@ -5456,7 +5456,7 @@ Page O
|
||||
13 O
|
||||
de O
|
||||
18 O
|
||||
Plan O
|
||||
Plan B-VILLE
|
||||
de O
|
||||
soins O
|
||||
Jour O
|
||||
@@ -7304,7 +7304,7 @@ rendu O
|
||||
au O
|
||||
format O
|
||||
texte O
|
||||
Bayonne, O
|
||||
Bayonne, B-VILLE
|
||||
le O
|
||||
03/10/2023 O
|
||||
Docteur O
|
||||
|
||||
Reference in New Issue
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