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feat(phase2): Fine-tuning CamemBERT-bio v2 (F1=0.90) + enrichissement données

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- Fine-tuning camembert-bio-base : F1=0.903, Recall=0.930 (vs 0.89/0.85)
- Data augmentation : substitution noms INSEE (219K patronymes, x3 copies)
- Hard negatives BDPM (5.7K médicaments) + QUAERO (1319 termes médicaux)
- Annotations silver enrichies par gazetteers (+612 VILLE, +5 HOPITAL)
- Export silver avec support multi-répertoires (--extra-dir)
- Gazetteers QUAERO : CHEM, DISO, PROC, ANAT depuis DrBenchmark/QUAERO
- Gazetteers INSEE : noms de famille fréquents (96K) et complets (219K)
- Batch silver 1194 PDFs (run_batch_silver_export.py) pour dataset v3

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
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Domi31tls
2026-03-10 02:06:08 +01:00
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132
data/silver_annotations/trackare-99246761-23159905_99246761_23159905.bio
View File

@@ -69,7 +69,7 @@ No: O
Localisation: O
NEURO-CHIRURGIE O
Médecin O
courant: O
courant: B-VILLE
DR. O
Joe B-PER
FADDOUL I-PER
@@ -95,11 +95,11 @@ Maria B-PER
BISCAY- I-PER
SALLABERRY I-PER
Le O
BOURG B-PER
BOURG O
CABINET O
ETXEBARNONDOA B-PER
64780 I-PER
IRISSARRY B-ZIP
ETXEBARNONDOA O
64780 B-ZIP
IRISSARRY I-ZIP
05 I-ZIP
59 B-TEL
49 I-TEL
@@ -185,7 +185,7 @@ Note O
Aucune O
donnée O
renseignée O
Signes O
Signes B-VILLE
vitaux O
Item O
de O
@@ -870,20 +870,20 @@ Note O
IDE O
Aline B-PER
STRECHKOV I-PER
23/08/2023 O
23:56 O
23/08/2023 B-DATE_NAISSANCE
23:56 I-DATE_NAISSANCE
Note O
IDE O
Emeline B-PER
DUMOULIN I-PER
23/08/2023 O
16:01 O
23/08/2023 B-DATE_NAISSANCE
16:01 I-DATE_NAISSANCE
Note O
IDE O
Mayalen B-PER
BARRAL I-PER
23/08/2023 O
10:55 O
23/08/2023 B-DATE_NAISSANCE
10:55 I-DATE_NAISSANCE
Note O
IDE O
Aurélie B-PER
@@ -946,7 +946,7 @@ Enveloppe O
de O
sortie O
complète O
Dort O
Dort B-PER
lors O
du O
1er O
@@ -983,7 +983,7 @@ Devenir O
En O
attente O
de O
place O
place B-VILLE
à O
Marienia B-PER
Sa O
@@ -1307,7 +1307,7 @@ INFECTIEUX O
: O
Apyrexie O
Plaie O
vue O
vue B-VILLE
par O
chir O
→ O
@@ -1442,7 +1442,7 @@ Arrêté O
Le O
débit O
en O
cours O
cours B-VILLE
est O
: O
.14583333333333334 O
@@ -1471,9 +1471,9 @@ CEFAZOLINE O
MYL O
2G O
PDR O
INJ O
IV O
IM O
INJ B-PER
IV I-PER
IM I-PER
[1] O
Flacon(s) O
7000 O
@@ -1499,7 +1499,7 @@ modifié. O
Le O
débit O
en O
cours O
cours B-VILLE
est O
: O
29.999999999999996 O
@@ -2259,8 +2259,8 @@ Mayalen I-PER
BARRAL I-PER
REPAS O
: O
AIDE O
PARTIELLE O
AIDE B-PER
PARTIELLE I-PER
Signé O
- O
Matin O
@@ -2340,8 +2340,8 @@ TOILETTE O
AU O
LAVABO O
: O
AIDE O
PARTIELLE O
AIDE B-PER
PARTIELLE I-PER
Signé O
- O
à O
@@ -2354,8 +2354,8 @@ BARRAL I-PER
TOILETTE O
DOUCHE O
: O
AIDE O
PARTIELLE O
AIDE B-PER
PARTIELLE I-PER
Signé O
- O
1xJour O
@@ -2439,7 +2439,7 @@ Mayalen I-PER
BARRAL I-PER
BLADER I-PER
SCAN I-PER
POST I-PER
POST O
MICTION O
: O
SURV O
@@ -2544,7 +2544,7 @@ Mayalen I-PER
BARRAL I-PER
PREMIER O
LEVER O
POST B-PER
POST O
OPERATOIRE O
Signé O
- O
@@ -2633,9 +2633,9 @@ Normal O
08:00 B-PER
Mayalen I-PER
BARRAL I-PER
BAS O
DE O
CONTENTION O
BAS I-PER
DE I-PER
CONTENTION I-PER
: O
POSE O
Arrêté O
@@ -2647,9 +2647,9 @@ Normal O
08:00 B-PER
Mayalen I-PER
BARRAL I-PER
BAS O
DE O
CONTENTION O
BAS I-PER
DE I-PER
CONTENTION I-PER
: O
RETRAIT O
Arrêté O
@@ -2663,8 +2663,8 @@ Mayalen I-PER
BARRAL I-PER
REPAS O
: O
AIDE O
COMPLETE O
AIDE B-PER
COMPLETE I-PER
Arrêté O
- O
Matin O
@@ -2678,8 +2678,8 @@ Mayalen I-PER
BARRAL I-PER
REPAS O
: O
AIDE O
PARTIELLE O
AIDE B-PER
PARTIELLE I-PER
Arrêté O
- O
Matin O
@@ -2806,7 +2806,7 @@ MAQUILLAGE, O
PROTHESES, O
VERNIS O
A O
ONGLES O
ONGLES B-VILLE
Réalisé O
- O
à O
@@ -3131,7 +3131,7 @@ Page O
8 O
de O
34 O
Plan O
Plan B-VILLE
de O
soins O
Jour O
@@ -5259,8 +5259,8 @@ Signé O
— O
DESHABILLAGE O
: O
AIDE O
PARTIELLE O
AIDE B-PER
PARTIELLE I-PER
- O
Soir O
[19h] O
@@ -5692,8 +5692,8 @@ Signé O
— O
HABILLAGE O
: O
AIDE O
PARTIELLE O
AIDE B-PER
PARTIELLE I-PER
- O
Matin O
[8h] O
@@ -5728,8 +5728,8 @@ Signé O
— O
REPAS O
: O
AIDE O
PARTIELLE O
AIDE B-PER
PARTIELLE I-PER
- O
Matin O
midi O
@@ -5748,8 +5748,8 @@ Signé O
— O
REPAS O
: O
AIDE O
PARTIELLE O
AIDE B-PER
PARTIELLE I-PER
- O
Matin O
midi O
@@ -5768,8 +5768,8 @@ Signé O
— O
REPAS O
: O
AIDE O
PARTIELLE O
AIDE B-PER
PARTIELLE I-PER
- O
Matin O
midi O
@@ -5788,8 +5788,8 @@ Signé O
— O
REPAS O
: O
AIDE O
PARTIELLE O
AIDE B-PER
PARTIELLE I-PER
- O
Matin O
midi O
@@ -8941,7 +8941,7 @@ Page O
20 O
de O
34 O
Plan O
Plan B-VILLE
de O
soins O
Jour O
@@ -11003,8 +11003,8 @@ Signé O
— O
DESHABILLAGE O
: O
AIDE O
PARTIELLE O
AIDE B-PER
PARTIELLE I-PER
- O
Soir O
[19h] O
@@ -11193,8 +11193,8 @@ Signé O
— O
HABILLAGE O
: O
AIDE O
PARTIELLE O
AIDE B-PER
PARTIELLE I-PER
- O
Matin O
[8h] O
@@ -11472,8 +11472,8 @@ Signé O
— O
REPAS O
: O
AIDE O
PARTIELLE O
AIDE B-PER
PARTIELLE I-PER
- O
Matin O
midi O
@@ -11492,8 +11492,8 @@ Signé O
— O
REPAS O
: O
AIDE O
PARTIELLE O
AIDE B-PER
PARTIELLE I-PER
- O
Matin O
midi O
@@ -11512,8 +11512,8 @@ Signé O
— O
REPAS O
: O
AIDE O
PARTIELLE O
AIDE B-PER
PARTIELLE I-PER
- O
Matin O
midi O
@@ -11532,8 +11532,8 @@ Signé O
— O
REPAS O
: O
AIDE O
PARTIELLE O
AIDE B-PER
PARTIELLE I-PER
- O
Matin O
midi O
@@ -15022,7 +15022,7 @@ Quelques O
colonies O
de O
Staphylococcus O
aure O
aure B-VILLE
+ O
Antibiogramme O
Culture O