feat(phase2): Fine-tuning CamemBERT-bio v2 (F1=0.90) + enrichissement données
- Fine-tuning camembert-bio-base : F1=0.903, Recall=0.930 (vs 0.89/0.85) - Data augmentation : substitution noms INSEE (219K patronymes, x3 copies) - Hard negatives BDPM (5.7K médicaments) + QUAERO (1319 termes médicaux) - Annotations silver enrichies par gazetteers (+612 VILLE, +5 HOPITAL) - Export silver avec support multi-répertoires (--extra-dir) - Gazetteers QUAERO : CHEM, DISO, PROC, ANAT depuis DrBenchmark/QUAERO - Gazetteers INSEE : noms de famille fréquents (96K) et complets (219K) - Batch silver 1194 PDFs (run_batch_silver_export.py) pour dataset v3 Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
This commit is contained in:
@@ -21,7 +21,7 @@ CEDEX I-ZIP
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||||
GERONTOLOGIE O
|
||||
- O
|
||||
Court O
|
||||
Séj B-PER
|
||||
Séj O
|
||||
Gériatrique O
|
||||
3ème O
|
||||
ét O
|
||||
@@ -78,7 +78,7 @@ No: O
|
||||
23165708 B-NDA
|
||||
Localisation: O
|
||||
Court O
|
||||
Séj B-PER
|
||||
Séj O
|
||||
Gériatrique O
|
||||
3ème O
|
||||
ét O
|
||||
@@ -169,7 +169,7 @@ prévenir O
|
||||
(Trakcare) O
|
||||
Autre O
|
||||
LES O
|
||||
GIRANDIERESBayonne O
|
||||
GIRANDIERESBayonne B-PER
|
||||
FRANCE O
|
||||
05 B-TEL
|
||||
59 I-TEL
|
||||
@@ -210,7 +210,7 @@ Note O
|
||||
Aucune O
|
||||
donnée O
|
||||
renseignée O
|
||||
Signes O
|
||||
Signes B-VILLE
|
||||
vitaux O
|
||||
Item O
|
||||
de O
|
||||
@@ -362,7 +362,7 @@ N.: O
|
||||
GERONTOLOGIE O
|
||||
- O
|
||||
Court O
|
||||
Séj B-PER
|
||||
Séj O
|
||||
Gériatrique O
|
||||
3ème O
|
||||
ét O
|
||||
@@ -699,7 +699,7 @@ bilan O
|
||||
cardiaque O
|
||||
avec O
|
||||
clinique, O
|
||||
bio O
|
||||
bio B-VILLE
|
||||
et O
|
||||
ETT O
|
||||
dans O
|
||||
@@ -714,7 +714,7 @@ recherche O
|
||||
d'une O
|
||||
splénomégalie O
|
||||
au O
|
||||
cours O
|
||||
cours B-VILLE
|
||||
de O
|
||||
cette O
|
||||
HDJ O
|
||||
@@ -801,7 +801,7 @@ crépitants O
|
||||
remontant O
|
||||
à O
|
||||
mi O
|
||||
champs O
|
||||
champs B-VILLE
|
||||
Abdomen O
|
||||
souple, O
|
||||
dépressible, O
|
||||
@@ -952,8 +952,8 @@ poids O
|
||||
à O
|
||||
surveiller) O
|
||||
Sur O
|
||||
le O
|
||||
plan O
|
||||
le B-VILLE
|
||||
plan I-VILLE
|
||||
hématologique O
|
||||
Anémie O
|
||||
autour O
|
||||
@@ -1001,8 +1001,8 @@ traitement O
|
||||
par O
|
||||
EPO B-PER
|
||||
au O
|
||||
long O
|
||||
cours O
|
||||
long B-VILLE
|
||||
cours B-VILLE
|
||||
car O
|
||||
objectifs O
|
||||
à O
|
||||
@@ -1068,7 +1068,7 @@ un O
|
||||
contexte O
|
||||
d'IU O
|
||||
à O
|
||||
Klebsielle B-VILLE
|
||||
Klebsielle O
|
||||
sous O
|
||||
AUGMENTIN O
|
||||
avec O
|
||||
@@ -1226,8 +1226,8 @@ PO O
|
||||
depuis O
|
||||
hier O
|
||||
Sur O
|
||||
le O
|
||||
plan O
|
||||
le B-VILLE
|
||||
plan I-VILLE
|
||||
de O
|
||||
l'anémie O
|
||||
Anémie O
|
||||
@@ -1252,8 +1252,8 @@ J8 O
|
||||
à O
|
||||
faire O
|
||||
Sur O
|
||||
le O
|
||||
plan O
|
||||
le B-VILLE
|
||||
plan I-VILLE
|
||||
du O
|
||||
diabète O
|
||||
HbA1C O
|
||||
@@ -1465,7 +1465,7 @@ au O
|
||||
dessus O
|
||||
des O
|
||||
mi O
|
||||
champs O
|
||||
champs B-VILLE
|
||||
avec O
|
||||
sibilants O
|
||||
dans O
|
||||
@@ -1477,7 +1477,7 @@ au O
|
||||
dessus O
|
||||
des O
|
||||
genoux O
|
||||
Bio O
|
||||
Bio B-VILLE
|
||||
: O
|
||||
- O
|
||||
iono O
|
||||
@@ -1551,7 +1551,7 @@ puis O
|
||||
réévaluation O
|
||||
avec O
|
||||
contrôle O
|
||||
bio O
|
||||
bio B-VILLE
|
||||
lundi O
|
||||
Sur O
|
||||
le O
|
||||
@@ -1637,7 +1637,7 @@ Dossier O
|
||||
TRAKCAREPharmacie O
|
||||
des O
|
||||
Gascons O
|
||||
(Bayonne) O
|
||||
(Bayonne) B-VILLE
|
||||
05 O
|
||||
59 O
|
||||
55 O
|
||||
@@ -1971,7 +1971,7 @@ Pas O
|
||||
de O
|
||||
trouble O
|
||||
cognitif. O
|
||||
Plan O
|
||||
Plan B-VILLE
|
||||
d'aide O
|
||||
au O
|
||||
domicile O
|
||||
@@ -2562,7 +2562,7 @@ sous O
|
||||
AUGMENTIN O
|
||||
PO O
|
||||
> O
|
||||
Bonne O
|
||||
Bonne B-VILLE
|
||||
évolution O
|
||||
clinico-biologique O
|
||||
après O
|
||||
@@ -2573,7 +2573,7 @@ traitement O
|
||||
antibiotique O
|
||||
Sur O
|
||||
le O
|
||||
plan O
|
||||
plan B-VILLE
|
||||
hématologique O
|
||||
Anémie O
|
||||
autour O
|
||||
@@ -2620,8 +2620,8 @@ traitement O
|
||||
par O
|
||||
EPO B-PER
|
||||
au O
|
||||
long O
|
||||
cours O
|
||||
long B-VILLE
|
||||
cours B-VILLE
|
||||
car O
|
||||
objectifs O
|
||||
à O
|
||||
@@ -2921,8 +2921,8 @@ Molles O
|
||||
Molles O
|
||||
Notes O
|
||||
paramédicales O
|
||||
IDE O
|
||||
MED O
|
||||
IDE B-PER
|
||||
MED I-PER
|
||||
GERIATRIQUE O
|
||||
HC O
|
||||
CPTE O
|
||||
@@ -2981,8 +2981,8 @@ DARMENDRAIL I-PER
|
||||
11:41 O
|
||||
Note O
|
||||
IDE O
|
||||
IDE O
|
||||
MED O
|
||||
IDE B-PER
|
||||
MED I-PER
|
||||
GERIATRIQUE O
|
||||
Pas O
|
||||
de O
|
||||
@@ -3133,7 +3133,7 @@ Douleur O
|
||||
- O
|
||||
Algique O
|
||||
au O
|
||||
talon O
|
||||
talon B-VILLE
|
||||
+ O
|
||||
coude O
|
||||
--> O
|
||||
@@ -3333,8 +3333,8 @@ rediscuter O
|
||||
bandes O
|
||||
de O
|
||||
contention O
|
||||
IDE O
|
||||
MED O
|
||||
IDE B-PER
|
||||
MED I-PER
|
||||
GERIATRIQUE O
|
||||
HC O
|
||||
CPTE O
|
||||
@@ -3359,7 +3359,7 @@ Note O
|
||||
A-Soignante B-PER
|
||||
Emmanuelle I-PER
|
||||
LATIL- I-PER
|
||||
BELLEC I-PER
|
||||
BELLEC O
|
||||
01/09/2023 O
|
||||
16:39 O
|
||||
Télévisons; O
|
||||
@@ -3373,7 +3373,7 @@ euros O
|
||||
de O
|
||||
pris O
|
||||
avec O
|
||||
son O
|
||||
son B-VILLE
|
||||
accord=> O
|
||||
20 O
|
||||
centimes O
|
||||
@@ -3451,11 +3451,11 @@ mobilisation: O
|
||||
a O
|
||||
marché O
|
||||
avec O
|
||||
son O
|
||||
son B-VILLE
|
||||
déambulateur O
|
||||
jusqu'à O
|
||||
la O
|
||||
salle O
|
||||
la B-VILLE
|
||||
salle I-VILLE
|
||||
de O
|
||||
bain, O
|
||||
installation O
|
||||
@@ -3503,7 +3503,7 @@ cardio: O
|
||||
ECG O
|
||||
fait O
|
||||
à O
|
||||
son O
|
||||
son B-VILLE
|
||||
entrée O
|
||||
normocarde O
|
||||
Normotendue O
|
||||
@@ -3648,7 +3648,7 @@ modifié. O
|
||||
Le O
|
||||
débit O
|
||||
en O
|
||||
cours O
|
||||
cours B-VILLE
|
||||
est O
|
||||
: O
|
||||
60 O
|
||||
@@ -4430,8 +4430,8 @@ Emilie I-PER
|
||||
OBRY I-PER
|
||||
REPAS O
|
||||
: O
|
||||
AIDE O
|
||||
PARTIELLE O
|
||||
AIDE B-PER
|
||||
PARTIELLE I-PER
|
||||
Réalisé O
|
||||
- O
|
||||
Matin O
|
||||
@@ -4473,8 +4473,8 @@ TOILETTE O
|
||||
AU O
|
||||
LAVABO O
|
||||
: O
|
||||
AIDE O
|
||||
PARTIELLE O
|
||||
AIDE B-PER
|
||||
PARTIELLE I-PER
|
||||
Réalisé O
|
||||
- O
|
||||
à O
|
||||
@@ -4491,8 +4491,8 @@ TOILETTE O
|
||||
AU O
|
||||
LAVABO O
|
||||
: O
|
||||
AIDE O
|
||||
PARTIELLE O
|
||||
AIDE B-PER
|
||||
PARTIELLE I-PER
|
||||
Réalisé O
|
||||
1 O
|
||||
Semaine O
|
||||
@@ -4505,8 +4505,8 @@ Normal O
|
||||
TOILETTE O
|
||||
DOUCHE O
|
||||
: O
|
||||
AIDE O
|
||||
PARTIELLE O
|
||||
AIDE B-PER
|
||||
PARTIELLE I-PER
|
||||
Réalisé O
|
||||
- O
|
||||
à O
|
||||
@@ -4850,7 +4850,7 @@ Page O
|
||||
11 O
|
||||
de O
|
||||
22 O
|
||||
Plan O
|
||||
Plan B-VILLE
|
||||
de O
|
||||
soins O
|
||||
Jour O
|
||||
@@ -6324,8 +6324,8 @@ Réalisé O
|
||||
— O
|
||||
REPAS O
|
||||
: O
|
||||
AIDE O
|
||||
PARTIELLE O
|
||||
AIDE B-PER
|
||||
PARTIELLE I-PER
|
||||
- O
|
||||
Matin O
|
||||
midi O
|
||||
@@ -6344,8 +6344,8 @@ Réalisé O
|
||||
— O
|
||||
REPAS O
|
||||
: O
|
||||
AIDE O
|
||||
PARTIELLE O
|
||||
AIDE B-PER
|
||||
PARTIELLE I-PER
|
||||
- O
|
||||
Matin O
|
||||
midi O
|
||||
@@ -6364,8 +6364,8 @@ Réalisé O
|
||||
— O
|
||||
REPAS O
|
||||
: O
|
||||
AIDE O
|
||||
PARTIELLE O
|
||||
AIDE B-PER
|
||||
PARTIELLE I-PER
|
||||
- O
|
||||
Matin O
|
||||
midi O
|
||||
@@ -6384,8 +6384,8 @@ Réalisé O
|
||||
— O
|
||||
REPAS O
|
||||
: O
|
||||
AIDE O
|
||||
PARTIELLE O
|
||||
AIDE B-PER
|
||||
PARTIELLE I-PER
|
||||
- O
|
||||
Matin O
|
||||
midi O
|
||||
@@ -7091,7 +7091,7 @@ Page O
|
||||
16 O
|
||||
de O
|
||||
22 O
|
||||
Plan O
|
||||
Plan B-VILLE
|
||||
de O
|
||||
soins O
|
||||
Jour O
|
||||
@@ -8283,7 +8283,7 @@ rendu O
|
||||
au O
|
||||
format O
|
||||
texte O
|
||||
Bayonne, O
|
||||
Bayonne, B-VILLE
|
||||
le O
|
||||
01/09/2023 O
|
||||
Docteur O
|
||||
@@ -9042,7 +9042,7 @@ spécificité O
|
||||
de O
|
||||
94,1% O
|
||||
(au O
|
||||
seuil O
|
||||
seuil B-VILLE
|
||||
de O
|
||||
94% O
|
||||
de O
|
||||
|
||||
Reference in New Issue
Block a user