Dom/anonymisation
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feat(phase2): Fine-tuning CamemBERT-bio v2 (F1=0.90) + enrichissement données

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- Fine-tuning camembert-bio-base : F1=0.903, Recall=0.930 (vs 0.89/0.85)
- Data augmentation : substitution noms INSEE (219K patronymes, x3 copies)
- Hard negatives BDPM (5.7K médicaments) + QUAERO (1319 termes médicaux)
- Annotations silver enrichies par gazetteers (+612 VILLE, +5 HOPITAL)
- Export silver avec support multi-répertoires (--extra-dir)
- Gazetteers QUAERO : CHEM, DISO, PROC, ANAT depuis DrBenchmark/QUAERO
- Gazetteers INSEE : noms de famille fréquents (96K) et complets (219K)
- Batch silver 1194 PDFs (run_batch_silver_export.py) pour dataset v3

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
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Domi31tls
2026-03-10 02:06:08 +01:00
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210
data/silver_annotations/trackare-00260974-23070213_00260974_23070213.bio
View File

@@ -32,7 +32,7 @@ de O
naissance: O
PEPOUEY B-PER
IPP: O
00260974 B-IPP
00260974 B-TEL
Nom O
et O
Prénom: O
@@ -61,7 +61,7 @@ ARGAINA O
94 O
ARGAINEKO B-VILLE
BIDEA I-VILLE
Ville O
Ville B-VILLE
de O
résidence: O
ST B-VILLE
@@ -167,7 +167,7 @@ Note O
Aucune O
donnée O
renseignée O
Signes O
Signes B-VILLE
vitaux O
Item O
de O
@@ -855,9 +855,9 @@ plan O
du O
devenir, O
patiente O
vue O
vue B-VILLE
avec O
son O
son B-VILLE
époux O
et O
son O
@@ -930,7 +930,7 @@ le O
Souhaite O
RAD O
a O
Anglet O
Anglet B-VILLE
en O
HAD O
possiblement O
@@ -1107,7 +1107,7 @@ et O
de O
poursuite O
d'une O
bonne O
bonne B-VILLE
évolution O
clinique, O
sortie O
@@ -1185,10 +1185,10 @@ Bladder O
négatif. O
Sur O
le O
plan O
plan B-VILLE
antalgique O
: O
Faux O
Faux B-VILLE
mouvement O
cette O
nuit O
@@ -1516,7 +1516,7 @@ patiente O
altérée O
sur O
le O
plan O
plan B-VILLE
général, O
OMS2/3. O
> O
@@ -1530,7 +1530,7 @@ traitement O
antalgique. O
Sur O
le O
plan O
plan B-VILLE
infectieux O
: O
Pic O
@@ -1553,8 +1553,8 @@ modification O
de O
l'antibiothérapie. O
Sur O
le O
plan O
le B-VILLE
plan I-VILLE
général O
: O
Normalisation O
@@ -1637,8 +1637,8 @@ NaCl O
arrêt O
hydratation. O
Sur O
le O
plan O
le B-VILLE
plan I-VILLE
infectieux O
: O
Apyrétique O
@@ -1786,8 +1786,8 @@ supposée O
au O
DOLIPRANE. O
Sur O
le O
plan O
le B-VILLE
plan I-VILLE
infectieux, O
apyrétique O
sous O
@@ -1817,8 +1817,8 @@ d'antibiothérapie O
au O
total O
Sur O
le O
plan O
le B-VILLE
plan I-VILLE
oncologique, O
TDM O
TAP O
@@ -1858,8 +1858,8 @@ difficile O
à O
obtenir. O
Sur O
le O
plan O
le B-VILLE
plan I-VILLE
du O
devenir, O
patiente O
@@ -1892,8 +1892,8 @@ les O
antalgiques O
prescrits. O
Sur O
le O
plan O
le B-VILLE
plan I-VILLE
infectieux, O
apyrétique O
sous O
@@ -1930,8 +1930,8 @@ de O
demande O
d'antalgiques. O
Sur O
le O
plan O
le B-VILLE
plan I-VILLE
infectieux, O
apyrétique O
depuis O
@@ -1947,7 +1947,7 @@ de O
la O
lésion O
de O
cheville O
cheville B-VILLE
biopsiée, O
en O
faveur O
@@ -1974,7 +1974,7 @@ manière O
significative, O
antibiogramme O
en O
cours O
cours B-VILLE
et O
d'autres O
micro-organismes O
@@ -1998,7 +1998,7 @@ par O
la O
dermatologue O
de O
ville O
ville B-VILLE
: O
ATB O
locale O
@@ -2113,7 +2113,7 @@ sous O
traitement O
de O
3ème O
ligne O
ligne B-VILLE
par O
CABOMETYX O
pour O
@@ -2222,7 +2222,7 @@ faible. O
: O
ECBU O
devant O
signes O
signes B-VILLE
fonctionnels O
urinaires O
négatifs O
@@ -2239,7 +2239,7 @@ mesurant O
57 O
mm O
de O
grand O
grand B-VILLE
axe. O
Scanner O
TAP O
@@ -2551,7 +2551,7 @@ par O
une O
dermatologue O
en O
ville O
ville B-VILLE
sans O
argument O
pour O
@@ -2575,7 +2575,7 @@ OMS3 O
Asthénie O
au O
premier O
plan, O
plan, B-VILLE
paleur O
cutanéo O
muqueuse. O
@@ -2818,7 +2818,7 @@ au O
décours. O
Sur O
le O
plan O
plan B-VILLE
urologique O
: O
Un O
@@ -2842,7 +2842,7 @@ lombaire O
suite O
à O
un O
faux O
faux B-VILLE
mouvement O
sans O
déficit O
@@ -2920,7 +2920,7 @@ Nette O
amélioration O
sur O
le O
plan O
plan B-VILLE
général O
avec O
la O
@@ -3085,7 +3085,7 @@ consultation O
avec O
le O
Dr O
FRANCOIS. O
FRANCOIS. B-VILLE
SOLUPRED O
40mg O
: O
@@ -3259,7 +3259,7 @@ spontanément O
avec O
reprise O
d'une O
bonne O
bonne B-VILLE
miction O
sans O
sondage O
@@ -3321,11 +3321,11 @@ surveillance O
18/04/2023 O
08:45 O
18/04/2023 O
00:02 B-DATE_NAISSANCE
17/04/2023 I-DATE_NAISSANCE
16:07 I-DATE_NAISSANCE
17/04/2023 I-DATE_NAISSANCE
09:18 I-DATE_NAISSANCE
00:02 O
17/04/2023 O
16:07 O
17/04/2023 O
09:18 O
16/04/2023 O
15:40 O
16/04/2023 O
@@ -3553,10 +3553,10 @@ Note O
IDE O
Kamila B-PER
GAUTIER I-PER
17/04/2023 I-PER
19:12 I-PER
Voie B-DATE_NAISSANCE
d'abord: I-DATE_NAISSANCE
17/04/2023 O
19:12 O
Voie O
d'abord: O
Allo O
RI O
le O
@@ -3606,7 +3606,7 @@ complètement, O
crème O
ATB O
mise O
Thymie B-PER
Thymie O
: O
=> O
petit O
@@ -3631,7 +3631,7 @@ active O
=> O
visite O
de O
son O
son B-VILLE
mari O
et O
son O
@@ -3647,10 +3647,10 @@ Note O
IDE O
Delphine B-PER
DANDO I-PER
17/04/2023 I-PER
14:30 I-PER
Voie B-DATE_NAISSANCE
d'abord I-DATE_NAISSANCE
17/04/2023 O
14:30 O
Voie O
d'abord O
: O
=> O
piccline O
@@ -3790,7 +3790,7 @@ GARNIER I-PER
A O
eu O
des O
selles O
selles B-VILLE
à O
deux O
reprises O
@@ -3834,7 +3834,7 @@ Transit O
=> O
pas O
de O
selles O
selles B-VILLE
ce O
jour O
mais O
@@ -4040,7 +4040,7 @@ surveillance O
apyrétique O
, O
non O
monté O
monté B-VILLE
ELIMINATION O
donnée O
urine O
@@ -4149,7 +4149,7 @@ se O
gère. O
Mieux O
au O
cours O
cours B-VILLE
de O
l'AM. O
Débit O
@@ -4163,7 +4163,7 @@ Elimination O
urines O
s'éclaircissant O
au O
cours O
cours B-VILLE
de O
l'après O
midi, O
@@ -4578,7 +4578,7 @@ signalé O
et O
recontrôlé O
à O
son O
son B-VILLE
retour O
à O
37°4c. O
@@ -4608,7 +4608,7 @@ niveau O
de O
l'IRM O
Résultats O
bio O
bio B-VILLE
: O
carence O
en O
@@ -4630,9 +4630,9 @@ RAD O
demain O
13/04 O
avec O
son O
son B-VILLE
époux O
vers O
vers B-VILLE
10h-10h30 O
Examen O
=> O
@@ -4794,7 +4794,7 @@ Note O
IDE O
Manon B-PER
PHARISIER- I-PER
BISCAYLEUX O
BISCAYLEUX I-PER
07/04/2023 O
20:11 O
Traitements O
@@ -4945,7 +4945,7 @@ sous O
traitement O
de O
3ème O
ligne O
ligne B-VILLE
par O
CABOMETYX O
pour O
@@ -5136,7 +5136,7 @@ modifié. O
Le O
débit O
en O
cours O
cours B-VILLE
est O
: O
3 O
@@ -5178,7 +5178,7 @@ SILVA I-PER
Le O
débit O
en O
cours O
cours B-VILLE
est O
: O
41.666666666666664 O
@@ -5187,8 +5187,8 @@ par O
1 O
hrs. O
SODIUM O
CHL O
MACO O
CHL B-PER
MACO I-PER
0,9% O
INJ O
PP O
@@ -5215,7 +5215,7 @@ modifié. O
Le O
débit O
en O
cours O
cours B-VILLE
est O
: O
40 O
@@ -5251,7 +5251,7 @@ modifié. O
Le O
débit O
en O
cours O
cours B-VILLE
est O
: O
16 O
@@ -5596,8 +5596,8 @@ CLOT I-PER
TRANSIPEG O
5,9G O
PDR O
ORALE O
SACHET O
ORALE B-PER
SACHET I-PER
[20] O
Sachet(s) O
2 O
@@ -5879,7 +5879,7 @@ Emma I-PER
CLOT I-PER
Voie O
d`administration: O
BUCCALE B-PER
BUCCALE O
Statut O
des O
prescriptions: O
@@ -5902,8 +5902,8 @@ PAS O
AVALER O
+++ O
SODIUM O
BIC O
BAX O
BIC B-PER
BAX I-PER
1,4% O
POC O
CFX O
@@ -5944,8 +5944,8 @@ PAS O
AVALER O
+++ O
SODIUM O
BIC O
BAX O
BIC B-PER
BAX I-PER
1,4% O
POC O
CFX O
@@ -6022,7 +6022,7 @@ POSE O
DE O
PICCLINE O
En O
cours O
cours B-VILLE
DR. O
Fabio B-PER
DA I-PER
@@ -6436,8 +6436,8 @@ valider O
Emma B-PER
CLOT I-PER
SODIUM O
BIC O
BAX O
BIC B-PER
BAX I-PER
1,4% O
POC O
CFX O
@@ -6530,7 +6530,7 @@ Page O
13 O
de O
25 O
Plan O
Plan B-VILLE
de O
soins O
Jour O
@@ -6553,8 +6553,8 @@ Soir O
Signé O
— O
SODIUM O
BIC O
BAX O
BIC B-PER
BAX I-PER
1,4% O
POC O
CFX O
@@ -6602,8 +6602,8 @@ AVALER O
Signé O
— O
SODIUM O
BIC O
BAX O
BIC B-PER
BAX I-PER
1,4% O
POC O
CFX O
@@ -6651,8 +6651,8 @@ AVALER O
Signé O
— O
SODIUM O
BIC O
BAX O
BIC B-PER
BAX I-PER
1,4% O
POC O
CFX O
@@ -7256,8 +7256,8 @@ Signé O
MAG O
2 O
PDR O
ORALE O
SACHET O
ORALE B-PER
SACHET I-PER
- O
2,25G O
poudre O
@@ -7880,7 +7880,7 @@ Page O
16 O
de O
25 O
Plan O
Plan B-VILLE
de O
soins O
Jour O
@@ -7905,8 +7905,8 @@ Soir O
Signé O
— O
SODIUM O
BIC O
BAX O
BIC B-PER
BAX I-PER
1,4% O
POC O
CFX O
@@ -7954,8 +7954,8 @@ AVALER O
Signé O
— O
SODIUM O
BIC O
BAX O
BIC B-PER
BAX I-PER
1,4% O
POC O
CFX O
@@ -8003,8 +8003,8 @@ AVALER O
Signé O
— O
SODIUM O
BIC O
BAX O
BIC B-PER
BAX I-PER
1,4% O
POC O
CFX O
@@ -8608,8 +8608,8 @@ Signé O
MAG O
2 O
PDR O
ORALE O
SACHET O
ORALE B-PER
SACHET I-PER
- O
2,25G O
poudre O
@@ -9205,7 +9205,7 @@ rendu O
au O
format O
texte O
Bayonne, O
Bayonne, B-VILLE
le O
12/04/2023 O
Docteur O
@@ -9536,7 +9536,7 @@ rendu O
au O
format O
texte O
Bayonne, O
Bayonne, B-VILLE
le O
12/04/2023 O
Docteur O
@@ -9592,9 +9592,9 @@ Inès I-PER
le O
12/04/2023 O
IRM O
DU O
RACHIS O
THORACO-LOMBAIRE O
DU B-PER
RACHIS I-PER
THORACO-LOMBAIRE I-PER
Indication O
: O
Bilan O
@@ -9817,7 +9817,7 @@ rendu O
au O
format O
texte O
Bayonne, O
Bayonne, B-VILLE
le O
18/04/2023 O
Docteur O
@@ -10060,7 +10060,7 @@ rendu O
au O
format O
texte O
Bayonne, O
Bayonne, B-VILLE
le O
18/04/2023 O
Docteur O