Initial commit — Pseudonymisation de PDF v5

- GUI v5 : vue unique épurée (tkinter), 2 étapes visuelles
- Core ONNX : anonymisation regex + NER optionnel
- Extraction globale des noms depuis champs structurés
  (Patient, Rédigé par, MME/Madame, DR)
- Génération simultanée PDF Image + PDF Anonymisé (structure préservée)
- Build Windows via Nuitka (script batch + GitHub Actions CI)
- install.sh pour setup/run Linux

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>

install.sh

@@ -0,0 +1,92 @@
+#!/usr/bin/env bash
+set -euo pipefail
+
+# ===========================
+#  install.sh — GUI ONNX only
+#  Ubuntu 24.04, Python 3.12
+# ===========================
+
+APP_DIR="$(cd "$(dirname "${BASH_SOURCE[0]}")" && pwd)"
+VENV_DIR="${APP_DIR}/.venv"
+PYTHON_BIN="${PYTHON_BIN:-python3}"
+GUI_MODELS="Pseudonymisation_Gui_V5.py"   # nom du fichier GUI (vue unique v5)
+
+usage() {
+  cat <<'USAGE'
+Usage:
+  ./install.sh --setup   # crée .venv + installe requirements (ONNX/Optimum/Transformers inclus)
+  ./install.sh --run     # lance la GUI ONNX
+  ./install.sh --clean   # supprime le venv .venv
+USAGE
+}
+
+log() { echo -e "[install] $*"; }
+die() { echo -e "[install:ERROR] $*" >&2; exit 1; }
+exists() { command -v "$1" >/dev/null 2>&1; }
+
+ensure_python() {
+  exists "${PYTHON_BIN}" || die "Python introuvable. Installez python3 (sudo apt-get install -y python3 python3-venv)."
+  log "Python: $(${PYTHON_BIN} -V)"
+}
+
+ensure_venv() {
+  if [[ ! -d "${VENV_DIR}" ]]; then
+    log "Création du virtualenv (.venv)…"
+    "${PYTHON_BIN}" -m venv "${VENV_DIR}" || die "Échec création venv."
+  fi
+  # shellcheck disable=SC1091
+  source "${VENV_DIR}/bin/activate"
+  python -m pip install --upgrade pip setuptools wheel >/dev/null
+}
+
+install_requirements() {
+  # shellcheck disable=SC1091
+  source "${VENV_DIR}/bin/activate"
+  [[ -f "${APP_DIR}/requirements.txt" ]] || die "requirements.txt introuvable à la racine du projet."
+  log "Installation des dépendances (requirements.txt)…"
+  pip install -r "${APP_DIR}/requirements.txt"
+  # docTR pour OCR de PDF scannés (optionnel, nécessite torch)
+  log "Installation de docTR pour l'OCR (optionnel)…"
+  pip install "python-doctr[torch]" || log "⚠ docTR non installé (optionnel – OCR désactivé pour les PDF scannés)"
+}
+
+run_gui_models() {
+  # shellcheck disable=SC1091
+  source "${VENV_DIR}/bin/activate"
+  export PYTHONUTF8=1
+  [[ -f "${APP_DIR}/${GUI_MODELS}" ]] || die "Fichier ${GUI_MODELS} introuvable à la racine du projet."
+  # Vérif onnxruntime
+  python - <<'PY' || (echo "[install] ONNX Runtime manquant (vérifiez requirements)."; exit 1)
+import onnxruntime as ort
+print("onnxruntime OK:", ort.__version__)
+PY
+  log "Lancement: ${GUI_MODELS}"
+  exec python "${APP_DIR}/${GUI_MODELS}"
+}
+
+clean_venv() {
+  [[ -d "${VENV_DIR}" ]] && rm -rf "${VENV_DIR}"
+  log "Venv supprimé."
+}
+
+MODE="${1:-}"
+[[ -z "${MODE}" ]] && { usage; exit 0; }
+
+ensure_python
+
+case "${MODE}" in
+  --setup)
+    ensure_venv
+    install_requirements
+    log "✅ Installation terminée. Lancez: ./install.sh --run"
+    ;;
+  --run)
+    ensure_venv
+    run_gui_models
+    ;;
+  --clean)
+    clean_venv
+    ;;
+  *)
+    usage; exit 1 ;;
+esac