Initial commit
This commit is contained in:
Dom
193
omop/run.sh
Executable file
193
omop/run.sh
Executable file
@@ -0,0 +1,193 @@
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#!/bin/bash
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# Couleurs pour les messages
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RED='\033[0;31m'
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GREEN='\033[0;32m'
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YELLOW='\033[1;33m'
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BLUE='\033[0;34m'
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NC='\033[0m' # No Color
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# Fonction pour afficher les messages
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log_info() {
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echo -e "${BLUE}[INFO]${NC} $1"
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}
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log_success() {
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echo -e "${GREEN}[SUCCESS]${NC} $1"
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}
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log_warning() {
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echo -e "${YELLOW}[WARNING]${NC} $1"
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}
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log_error() {
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echo -e "${RED}[ERROR]${NC} $1"
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}
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# Fonction pour nettoyer les processus à l'arrêt
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cleanup() {
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log_warning "Arrêt de la stack OMOP Pipeline..."
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if [ ! -z "$API_PID" ]; then
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||||
log_info "Arrêt de l'API (PID: $API_PID)"
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||||
kill $API_PID 2>/dev/null
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||||
fi
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||||
if [ ! -z "$FRONTEND_PID" ]; then
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||||
log_info "Arrêt du frontend (PID: $FRONTEND_PID)"
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||||
kill $FRONTEND_PID 2>/dev/null
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||||
fi
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log_success "Stack arrêtée proprement"
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exit 0
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}
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# Capturer Ctrl+C
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trap cleanup INT TERM
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# Banner
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echo ""
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echo "╔═══════════════════════════════════════════════════════════╗"
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echo "║ ║"
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echo "║ 🚀 OMOP PIPELINE - STACK COMPLÈTE 🚀 ║"
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echo "║ ║"
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echo "╚═══════════════════════════════════════════════════════════╝"
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echo ""
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# Vérifier si on est dans le bon répertoire
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if [ ! -f "run_api.py" ]; then
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||||
log_error "Ce script doit être exécuté depuis le répertoire omop/"
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exit 1
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fi
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# 1. Vérifier Python
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log_info "Vérification de Python..."
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if ! command -v python3 &> /dev/null; then
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||||
log_error "Python 3 n'est pas installé"
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exit 1
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fi
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||||
PYTHON_VERSION=$(python3 --version)
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||||
log_success "Python trouvé: $PYTHON_VERSION"
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# 2. Vérifier Node.js
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||||
log_info "Vérification de Node.js..."
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||||
if ! command -v node &> /dev/null; then
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||||
log_error "Node.js n'est pas installé"
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||||
exit 1
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||||
fi
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||||
NODE_VERSION=$(node --version)
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||||
log_success "Node.js trouvé: $NODE_VERSION"
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||||
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||||
# 3. Vérifier npm
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||||
log_info "Vérification de npm..."
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||||
if ! command -v npm &> /dev/null; then
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||||
log_error "npm n'est pas installé"
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||||
exit 1
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||||
fi
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||||
NPM_VERSION=$(npm --version)
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||||
log_success "npm trouvé: v$NPM_VERSION"
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# 4. Vérifier PostgreSQL
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log_info "Vérification de PostgreSQL..."
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if ! command -v psql &> /dev/null; then
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||||
log_warning "psql n'est pas trouvé dans le PATH"
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||||
else
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PSQL_VERSION=$(psql --version)
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||||
log_success "PostgreSQL trouvé: $PSQL_VERSION"
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||||
fi
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||||
# 5. Installer les dépendances Python si nécessaire
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||||
log_info "Vérification des dépendances Python..."
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if ! python3 -c "import fastapi" 2>/dev/null; then
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||||
log_warning "Dépendances Python manquantes, installation..."
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||||
pip install -r requirements.txt -q
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||||
pip install -r requirements-api.txt -q
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||||
log_success "Dépendances Python installées"
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||||
else
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||||
log_success "Dépendances Python OK"
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||||
fi
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||||
# 6. Installer les dépendances npm si nécessaire
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log_info "Vérification des dépendances frontend..."
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||||
if [ ! -d "frontend/node_modules" ]; then
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||||
log_warning "node_modules manquant, installation..."
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cd frontend
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||||
npm install --silent
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||||
cd ..
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||||
log_success "Dépendances frontend installées"
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||||
else
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||||
log_success "Dépendances frontend OK"
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||||
fi
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||||
# 7. Vérifier la connexion à la base de données
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log_info "Vérification de la connexion PostgreSQL..."
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||||
if psql -U dom -d omop_cdm -c "SELECT 1;" &> /dev/null; then
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||||
log_success "Connexion à la base de données OK"
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||||
else
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||||
log_warning "Impossible de se connecter à la base de données"
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||||
log_warning "Assurez-vous que PostgreSQL est démarré et que la base 'omop_cdm' existe"
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fi
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echo ""
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||||
log_info "═══════════════════════════════════════════════════════════"
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log_info " DÉMARRAGE DE LA STACK"
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||||
log_info "═══════════════════════════════════════════════════════════"
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||||
echo ""
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# 8. Démarrer l'API en arrière-plan
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log_info "Démarrage de l'API FastAPI..."
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python3 run_api.py > logs/api.log 2>&1 &
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||||
API_PID=$!
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# Attendre que l'API démarre
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sleep 3
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||||
# Vérifier si l'API est démarrée
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||||
if ps -p $API_PID > /dev/null; then
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||||
log_success "API démarrée (PID: $API_PID)"
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||||
log_success "API disponible sur: http://localhost:8001"
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||||
log_success "Documentation API: http://localhost:8001/docs"
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||||
else
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||||
log_error "Échec du démarrage de l'API"
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||||
log_error "Consultez logs/api.log pour plus de détails"
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||||
exit 1
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||||
fi
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# 9. Démarrer le frontend en arrière-plan
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log_info "Démarrage du frontend React..."
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cd frontend
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npm run dev > ../logs/frontend.log 2>&1 &
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||||
FRONTEND_PID=$!
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||||
cd ..
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||||
# Attendre que le frontend démarre
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||||
sleep 5
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||||
# Vérifier si le frontend est démarré
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||||
if ps -p $FRONTEND_PID > /dev/null; then
|
||||
log_success "Frontend démarré (PID: $FRONTEND_PID)"
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||||
log_success "Frontend disponible sur: http://localhost:4400"
|
||||
else
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||||
log_error "Échec du démarrage du frontend"
|
||||
log_error "Consultez logs/frontend.log pour plus de détails"
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||||
kill $API_PID 2>/dev/null
|
||||
exit 1
|
||||
fi
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||||
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||||
echo ""
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||||
log_success "═══════════════════════════════════════════════════════════"
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log_success " ✅ STACK OMOP PIPELINE DÉMARRÉE ✅"
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log_success "═══════════════════════════════════════════════════════════"
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||||
echo ""
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||||
echo " 📊 Frontend: http://localhost:4400"
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echo " 🔌 API: http://localhost:8001"
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||||
echo " 📚 Documentation: http://localhost:8001/docs"
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||||
echo ""
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||||
echo " 📝 Logs API: logs/api.log"
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||||
echo " 📝 Logs Frontend: logs/frontend.log"
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echo ""
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log_info "Appuyez sur Ctrl+C pour arrêter la stack"
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echo ""
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||||
# Attendre indéfiniment (les processus tournent en arrière-plan)
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wait
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